Anàlisi de cribratges CRISPR
L'anàlisi de cribratges CRISPR processa dades de cribratges genètics combinats utilitzant CRISPR-Cas9 per identificar gens necessaris per al creixement cel·lular, la supervivència o el fenotip en condicions específiques. Desenvolupada per Zhang, Sanjana i altres, aquesta pipeline computacional transforma les lectures de seqüenciació de les abundàncies d'ARN guia en llistes classificades de gens funcionals.
Llegeix el mètode complet
Inicia la sessió amb un compte gratuït per llegir aquesta secció.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Fonts
- Shalem, O., Sanjana, N. E., Hartenian, E., Shi, X., Scott, D. A., Mikkelsen, T. S., ... & Zhang, F. (2014). Genome-scale CRISPR-Cas9 knockout screening in human cells. Science, 343(6166), 84-87. DOI: 10.1126/science.1247005 ↗
- Hart, T., Chandrashekhar, M., Aregger, M., Steinhart, Z., Brown, K. R., MacLeod, G., ... & Moffat, J. (2015). High-resolution CRISPR screens reveal fitness genes and pathways. Molecular Systems Biology, 11(8), 820. link ↗
- King, J. B., Palmer, A. C., & Sorger, P. K. (2020). Application of a genetic algorithm designed for flexible objective optimization in pharmaceutical research and development. Cancer Research, 79(13 Supplement), 3435. link ↗
Com citar aquesta pàgina
ScholarGate. (2026, June 3). CRISPR Screening Data Analysis and Hit Identification. ScholarGate. https://scholargate.app/ca/bioinformatics/crispr-screen-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Muntatge de transcripció *de novo*Bioinformàtica↔ compare
- Cerca de perfils HMMERBioinformàtica↔ compare
- Binning metagenòmicBioinformàtica↔ compare
Citat per
Has vist cap problema en aquesta pàgina? Informa'n o suggereix una correcció →