Anàlisi de la variació del nombre de còpies en cèl·lules individuals
L'anàlisi de la variació del nombre de còpies en cèl·lules individuals (scCNV) detecta guanys i pèrdues de segments genòmics dins de cèl·lules individuals, cosa que permet als investigadors resoldre l'heterogeneïtat intratumoral, reconstruir l'evolució clonal i distingir les cèl·lules malignes de les normals amb resolució d'una sola cèl·lula. Es pot aplicar directament a dades de seqüenciació de genoma sencer de cèl·lules individuals o inferir-se a partir de senyals de profunditat de lectura en experiments scRNA-seq o scATAC-seq.
Llegeix el mètode complet
Inicia la sessió amb un compte gratuït per llegir aquesta secció.
Mapa de mètodes
El veïnat de mètodes relacionats — seleccioneu un node per explorar-lo.
Fonts
- Garvin, T., Aboukhalil, R., Kendall, J., Baslan, T., Atwal, G. S., Hicks, J., Wigler, M., & Schatz, M. C. (2015). Interactive analysis and assessment of single-cell copy-number variations. Nature Methods, 12(11), 1058–1060. link ↗
- Gao, R., Bai, S., Henderson, Y. C., Lin, Y., Schalck, A., Yan, Y., Kumar, T., Hu, M., Sei, E., Davis, A., Wang, F., Shaitelman, S. F., Wang, J. R., Chen, K., Moulder, S., Lai, S. Y., & Navin, N. E. (2021). Delineating copy number and clonal substructure in human tumors from single-cell transcriptomes. Nature Biotechnology, 39(5), 599–608. link ↗
Com citar aquesta pàgina
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ca/bioinformatics/single-cell-copy-number-variation-analysis
Quin mètode?
Poseu aquest mètode al costat dels seus parents més pròxims i llegiu-los de costat a costat — la biblioteca disposa els llibres sobre la taula; la tria és vostra.
- Anàlisi de Variació del Nombre de CòpiesBioinformàtica↔ compara
- Estudi d'associació epigenòmica a cèl·lula única (scEWAS)Bioinformàtica↔ compara
- GWAS de cèl·lula únicaBioinformàtica↔ compara
- Anàlisi de RNA-seq de cèl·lules individualsBioinformàtica↔ compara
- Anàlisi d'expressió diferencial d'ARNseq d'una sola cèl·lulaBioinformàtica↔ compara
- Anomenament de variantsBioinformàtica↔ compara
Citat per
Has vist cap problema en aquesta pàgina? Informa'n o suggereix una correcció →