ScholarGate
Assistent
Process / pipelineBioinformatics / omics

Anàlisi de variants en sèrie temporal — Detecció longitudinal de mutacions somàtiques

L'anàlisi de variants en sèrie temporal és un pipeline bioinformàtic que identifica i rastreja variants genòmiques —típicament mutacions somàtiques— a través de múltiples mostres de seqüenciació recollides del mateix subjecte en diferents moments temporals. S'aplica àmpliament en genòmica del càncer per reconstruir l'evolució tumoral, monitorar la malaltia residual mínima i detectar l'emergència de clons resistents a la teràpia. Modelant conjuntament les freqüències al·lèliques de variants al llarg de la dimensió temporal, el mètode distingeix els canvis somàtics reals del soroll de seqüenciació i estima la dinàmica clonal al llarg del temps.

Obre a MethodMindAviatVídeoAviatBaixa les diapositives

Llegeix el mètode complet

Només per a membres

Inicia la sessió amb un compte gratuït per llegir aquesta secció.

Inicia la sessió

Mapa de mètodes

El veïnat de mètodes relacionats — seleccioneu un node per explorar-lo.

Anàlisi de variants en sèrie temporal
Expressió Diferencial en…

Fonts

  1. Nik-Zainal, S., et al. (2012). The life history of 21 breast cancers. Cell, 149(5), 994–1007. link
  2. McMahon, M., et al. (2021). Benchmarking algorithms for clonal evolution analysis using multi-region and longitudinal tumour sequencing data. Briefings in Bioinformatics, 22(3), bbaa163. link

Com citar aquesta pàgina

ScholarGate. (2026, June 3). Time-series Variant Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/ca/bioinformatics/time-series-variant-calling

Quin mètode?

Poseu aquest mètode al costat dels seus parents més pròxims i llegiu-los de costat a costat — la biblioteca disposa els llibres sobre la taula; la tria és vostra.

Compara de costat a costat
ScholarGateTime-series variant calling (Time-series Variant Calling). Recuperat el 2026-06-15 de https://scholargate.app/ca/bioinformatics/time-series-variant-calling · Conjunt de dades: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026