ScholarGate
Assistent
Process / pipelineBioinformatics / omics

Anàlisi d'ARNseq de cèl·lules úniques basada en xarxes

L'anàlisi d'ARNseq de cèl·lules úniques (scRNA-seq) basada en xarxes estén els fluxos de treball estàndard d'scRNA-seq construint i interrogant xarxes d'interacció molecular —xarxes reguladores gèniques, xarxes de coexpressió o grafs de comunicació cèl·lula-cèl·lula— a partir de dades transcriptòmiques de cèl·lules úniques. En lloc de tractar cada gen de manera independent, aquest enfocament captura l'activitat coordinada de circuits gènics i vies de senyalització intercel·lular dins i entre poblacions cel·lulars, permetent una visió a nivell de sistemes de la regulació transcripcional amb resolució de cèl·lula única.

Obre a MethodMindAviatVídeoAviatDownload slides

Llegeix el mètode complet

Només per a membres

Inicia la sessió amb un compte gratuït per llegir aquesta secció.

Inicia la sessió

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Fonts

  1. Aibar, S., González-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., ... & Aerts, S. (2017). SCENIC: single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083–1086. link
  2. Jin, S., Guerrero-Juarez, C. F., Zhang, L., Chang, I., Ramos, R., Kuan, C. H., ... & Nie, Q. (2021). Inference and analysis of cell-cell communication using CellChat. Nature Communications, 12(1), 1088. link

Com citar aquesta pàgina

ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ca/bioinformatics/network-based-single-cell-rna-seq-analysis

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side
ScholarGateNetwork-based single-cell RNA-seq analysis (Network-based Single-Cell RNA Sequencing Analysis). Recuperat el 2026-06-15 de https://scholargate.app/ca/bioinformatics/network-based-single-cell-rna-seq-analysis · Conjunt de dades: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026