Analisi Bayesiana di Arricchimento di Percorsi
L'analisi bayesiana di arricchimento di percorsi (Bayesian pathway enrichment analysis) verifica se un insieme predefinito di geni — un percorso biologico — è sistematicamente sovrarappresentato tra i geni che mostrano evidenza di attività differenziale in un esperimento. A differenza dei test classici di sovrarappresentazione, codifica la conoscenza biologica a priori come una distribuzione a priori e la aggiorna con i dati di espressione osservati, producendo probabilità a posteriori di arricchimento anziché p-value. Questa formulazione probabilistica gestisce naturalmente campioni di piccole dimensioni, percorsi multipli e la propagazione dell'incertezza in un quadro statistico coerente.
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Fonti
- Baldi, P., & Long, A. D. (2001). A Bayesian framework for the analysis of microarray expression data: regularized t-test and statistical inferences of gene changes. Bioinformatics, 17(6), 509–519. DOI: 10.1093/bioinformatics/17.6.509 ↗
- Newton, M. A., Quintana, F. A., Den Boon, J. A., Bhattacharya, S., & Ahlquist, P. (2004). Random-set methods identify distinct aspects of the enrichment signal in gene-set analysis. The Annals of Applied Statistics, 1(1), 85–106. link ↗
Come citare questa pagina
ScholarGate. (2026, June 3). Bayesian Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/it/bioinformatics/bayesian-pathway-enrichment-analysis
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