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GWAS basato su reti — Genome-Wide Association Study basato su reti

Il GWAS basato su reti integra i risultati del convenzionale studio di associazione sull'intero genoma con dati di reti biologiche — come reti di interazione proteina-proteina (PPI) o grafi di co-espressione genica — per identificare moduli genici o sottoreti rilevanti per la malattia. Invece di riportare solo i singoli SNP più significativi, questo approccio propaga i segnali di associazione attraverso le reti di interazione molecolare, facendo emergere cluster genici il cui segnale collettivo li implica nella biologia dei tratti complessi, anche quando nessuna singola variante raggiunge da sola la significatività sull'intero genoma.

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Fonti

  1. Wang, Q., Yu, H., Zhao, Z., & Jia, P. (2015). EW_dmGWAS: edge-weighted dense module search for genome-wide association studies and gene expression profiles. Bioinformatics, 31(15), 2591–2594. link
  2. Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations contributing to tumorigenesis. Nature Genetics, 47(2), 106–114. link

Come citare questa pagina

ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Genome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/it/bioinformatics/network-based-gwas

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ScholarGateNetwork-based GWAS (Network-based Genome-Wide Association Study). Consultato il 2026-06-15 da https://scholargate.app/it/bioinformatics/network-based-gwas · Insieme di dati: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026