Process / pipelineBioinformatics / omics

Pathway Enrichment Analysis — Biological Pathway Enrichment Analysis

Pathway enrichment analysis (PEA) er en statistisk tilgang, der tager en liste af gener eller proteiner af interesse – typisk afledt af et differentielt ekspressions- eller proteomik-eksperiment – og identificerer, hvilke foruddefinerede biologiske pathways eller funktionelle gen-sæt der er repræsenteret oftere end forventet ved tilfældighed. Ved at mappe individuelle molekylære ændringer til kuraterede pathway-vidensbaser såsom KEGG, Gene Ontology eller Reactome, oversætter PEA lange genlister til fortolkelige biologiske processer, hvilket gør det til et centralt værktøj i post-analysen af high-throughput omics-eksperimenter.

Åbn i MethodMindSnartVideoSnartDownload slides

Læs hele metoden

Kun for medlemmer

Log ind med en gratis konto for at læse dette afsnit.

Log ind

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Pathway Enrichment Analysis

Gen-sætsanrigelsesanalys…Metabolomikanalyse Netværksbaseret berigels…Proteomanalyse RNA-seq Differential Exp…Single-cell RNA-seq Anal…Bayesiansk ChIP-seq Peak…Bayesiansk eQTL-analyse Bayesiansk gen-sæt-berig…Bayesiansk GWAS

+43 more

Kilder

Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
Alexa, A., Rahnenführer, J., & Lengauer, T. (2006). Improved scoring of functional groups from gene expression data by decorrelating GO graph structure. Bioinformatics, 22(13), 1600–1607. DOI: 10.1093/bioinformatics/btl140 ↗

Sådan citerer du denne side

ScholarGate. (2026, June 3). Biological Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/da/bioinformatics/pathway-enrichment-analysis

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Gen-sætsanrigelsesanalyse (GSEA)Bioinformatik↔ compare
MetabolomikanalyseBioinformatik↔ compare
Netværksbaseret berigelsesanalyse af signalvejeBioinformatik↔ compare
ProteomanalyseBioinformatik↔ compare
RNA-seq Differential ExpressionBioinformatik↔ compare
Single-cell RNA-seq AnalyseBioinformatik↔ compare

Compare side by side →

Refereret af

Bayesiansk ChIP-seq Peak Calling Bayesiansk eQTL-analyse Bayesiansk gen-sæt-berigelsesanalyse (Bayesian GSEA)Bayesiansk GWAS Bayesiansk metabolomanalyse Bayesiansk Pathway Berigelsesanalyse Bayesiansk proteomikanalyse Bayesiansk RNA-seq Differential Expression Differential Epigenome-Wide Association Study Differential eQTL Analyse Differential Metabolomics Analyse Differential Pathway Enrichment Analysis Differential Proteomiksanalyse Epigenom-dækkende associationsstudie (EWAS)eQTL-analyse Gen-sætsanrigelsesanalyse (GSEA)Genomdækkende associationsstudie (GWAS)Maskinlæringsassisteret eQTL-analyse Maskinlærings-assisteret gen-sæt-anrigelsesanalyse Maskinlæringsassisteret mikrobiomdiversitetsanalyse Maskinlæringsassisteret RNA-seq-analyse af differentiel ekspression Maskinlæringsassisteret analyse af enkeltcelle-RNA-sekventering Metabolomikanalyse Multi-omics epigenom-bred associationsstudie Multi-omics gen-sætsanrigelsesanalyse Multi-omics metabolomics analysis Multi-omics Mikrobiom Diversitetsanalyse Multi-omisk proteomanalyse Multi-omics Single-Cell RNA-seq Analyse Netværksbaseret analyse af kopitalvarians Netværksbaseret Epigenom-Wide Association Study (Network EWAS)Netværksbaseret eQTL-analyse Netværksbaseret gen-sæt-berigelsesanalyse Netværksbaseret GWAS Netværksbaseret Metabolomik Analyse Netværksbaseret analyse af mikrobiel diversitet Netværksbaseret RNA-seq differential ekspressionsanalyse Netværksbaseret analyse af enkeltcelle RNA-seq Proteomanalyse RNA-seq Differential Expression Single-cell eQTL-analyse Single-cell Gene Set Enrichment Analysis Enkeltcelle GWAS Single-Cell Metabolomics Analyse Single-cell RNA-seq Analyse Analyse af differentiel ekspression i enkeltcelle-RNA-seq Tidsrække-gen-sæts-anrigelsesanalyse Tidsserie-metabolomikanalyse – sporing af metabolitdynamik over tid Tidsrækkeanalyse af mikrobiel diversitet Tidsrække-baseret pathway-anringsanalyse Tidsserie RNA-seq differentiel ekspression Tidsrækkeanalyse af enkeltcelle-RNA-sekventering

Har du fundet en fejl på denne side? Indberet den eller foreslå en rettelse →