Tidsrækkeanalyse af mikrobiel diversitet — Longitudinal analyse af mikrobiel diversitet
Tidsrækkeanalyse af mikrobiel diversitet sporer, hvordan mikrobielle samfunds rigdom, jævnhed og sammensætning ændrer sig over flere tidspunkter inden for de samme individer. Ved at kombinere standard diversitetsmetrikker med longitudinelle statistiske modeller adskilles sande tidsmæssige dynamikker fra interindividuel variation, hvilket identificerer, hvornår og hvordan forstyrrelser som kostændringer, antibiotikabehandling eller sygdomsdebut omformer mikrobiomet.
Læs hele metoden
Log ind med en gratis konto for at læse dette afsnit.
Metodekort
Nabolaget af beslægtede metoder — vælg en knude for at udforske.
Kilder
- Callahan, B. J., McMurdie, P. J., Rosen, M. J., Han, A. W., Johnson, A. J. A., & Holmes, S. P. (2016). DADA2: High-resolution sample inference from Illumina amplicon data. Nature Methods, 13(7), 581–583. DOI: 10.1038/nmeth.3869 ↗
- Chen, Y., Lun, A. T. L., & Smyth, G. K. (2023). Differential abundance testing on single-cell data using quasi-likelihood methods. Genome Biology, 24(1), 188. link ↗
Sådan citerer du denne side
ScholarGate. (2026, June 3). Longitudinal Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/da/bioinformatics/time-series-microbiome-diversity-analysis
Hvilken metode?
Stil denne metode ved siden af dens nærmeste slægtninge, og læs dem side om side — biblioteket lægger bøgerne på bordet; valget er dit.
- Multi-omics Mikrobiom DiversitetsanalyseBioinformatik↔ sammenlign
- Pathway Enrichment AnalysisBioinformatik↔ sammenlign
- RNA-seq Differential ExpressionBioinformatik↔ sammenlign
- Single-cell RNA-seq AnalyseBioinformatik↔ sammenlign
- Tidsserie RNA-seq differentiel ekspressionBioinformatik↔ sammenlign
Har du fundet en fejl på denne side? Indberet den eller foreslå en rettelse →