Enkeltcelle GWAS — Genomanalyser af celle-typespecifikke genetiske associationer
Enkeltcelle GWAS er en integrativ bioinformatisk pipeline, der kortlægger genom-omfattende associationsstudie (GWAS) signaler på enkeltcelle transkriptomiske landskaber for at identificere, hvilke celletyper og individuelle celler der bærer en uforholdsmæssig genetisk risiko for en sygdom eller egenskab. Ved at udnytte enkeltcelle RNA-seq atlas sammen med GWAS-resuméstatistikker bevæger den sig ud over vævs-niveau associationer for at afsløre de præcise cellulære kontekster, hvori sygdomsassocierede genetiske varianter udøver deres effekter.
Læs hele metoden
Log ind med en gratis konto for at læse dette afsnit.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Kilder
- Zhang, M. J., Hou, K., Dey, K. K., Sakaue, S., Jagadeesh, K. A., Weinand, K., ... & Price, A. L. (2022). Polygenic enrichment distinguishes disease associations of individual cells in single-cell RNA-seq data. Nature Genetics, 54(8), 1224-1234. link ↗
- Bryois, J., Calini, D., Macnair, W., Foo, L., Urich, E., Ortmann, W., ... & De Jager, P. L. (2022). Cell-type-specific cis-eQTLs in eight human brain cell types identify novel risk genes for psychiatric and neurological disorders. Nature Neuroscience, 25(8), 1104-1112. link ↗
Sådan citerer du denne side
ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell Genome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/da/bioinformatics/single-cell-gwas
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- eQTL-analyseBioinformatik↔ compare
- Genomdækkende associationsstudie (GWAS)Bioinformatik↔ compare
- Pathway Enrichment AnalysisBioinformatik↔ compare
- RNA-seq Differential ExpressionBioinformatik↔ compare
- Single-cell eQTL-analyseBioinformatik↔ compare
- Single-cell RNA-seq AnalyseBioinformatik↔ compare
Refereret af
Har du fundet en fejl på denne side? Indberet den eller foreslå en rettelse →