Multi-omics gen-sætsanrigelsesanalyse
Multi-omics gen-sætsanrigelsesanalyse (multi-omics GSEA) er en beregningsmæssig pipeline, der anvender GSEA-logik samtidigt på tværs af to eller flere molekylære målingslag – såsom transkriptomik, proteomik og metabolomik – for at identificere biologiske veje eller gen-sæt, der er koordineret dysregulerede på tværs af omics-platforme. Ved at integrere rangordnede molekylære signaturer fra hvert lag afsløres konvergens på vej-niveau, som ingen enkelt omics-platform kunne detektere alene.
Læs hele metoden
Log ind med en gratis konto for at læse dette afsnit.
Metodekort
Nabolaget af beslægtede metoder — vælg en knude for at udforske.
Kilder
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Meng, C., Zeleznik, O. A., Thallinger, G. G., Kuster, B., Gholami, A. M., & Culhane, A. C. (2016). Dimension reduction techniques for the integrative analysis of multi-omics data. Briefings in Bioinformatics, 17(4), 628–641. DOI: 10.1093/bib/bbv108 ↗
Sådan citerer du denne side
ScholarGate. (2026, June 3). Multi-Omics Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/da/bioinformatics/multi-omics-gene-set-enrichment-analysis
Hvilken metode?
Stil denne metode ved siden af dens nærmeste slægtninge, og læs dem side om side — biblioteket lægger bøgerne på bordet; valget er dit.
- Gen-sætsanrigelsesanalyse (GSEA)Bioinformatik↔ sammenlign
- Multi-omics-vejberigelsesanalyseBioinformatik↔ sammenlign
- Pathway Enrichment AnalysisBioinformatik↔ sammenlign
- ProteomanalyseBioinformatik↔ sammenlign
- RNA-seq Differential ExpressionBioinformatik↔ sammenlign
- Single-cell Gene Set Enrichment AnalysisBioinformatik↔ sammenlign
Refereret af
Similar methods
Har du fundet en fejl på denne side? Indberet den eller foreslå en rettelse →