Tidsrække-gen-sæts-anrigelsesanalyse — Dynamisk Pathway-anrigelse på tværs af tidspunkter
Tidsrække-gen-sæts-anrigelsesanalyse (TS-GSEA) udvider det klassiske GSEA-framework til at detektere biologisk koordinerede gen-sæt — pathways, gen-ontologi-termer eller kuraterede signaturer — hvis kollektive ekspression ændrer sig meningsfuldt over tid. I stedet for at sammenligne to snapshots, modellerer den den fulde temporale bane af gen-ekspression for at identificere hvilke funktionelle programmer der aktiveres, undertrykkes eller dynamisk omformes under en biologisk proces såsom udvikling, behandlingsrespons eller sygdomsprogression.
Læs hele metoden
Log ind med en gratis konto for at læse dette afsnit.
Metodekort
Nabolaget af beslægtede metoder — vælg en knude for at udforske.
Kilder
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Nueda, M. J., Tarazona, S., & Conesa, A. (2014). Next maSigPro: updating maSigPro bioconductor package for RNA-seq time series. Bioinformatics, 30(18), 2598–2602. DOI: 10.1093/bioinformatics/btu333 ↗
Sådan citerer du denne side
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/da/bioinformatics/time-series-gene-set-enrichment-analysis
Hvilken metode?
Stil denne metode ved siden af dens nærmeste slægtninge, og læs dem side om side — biblioteket lægger bøgerne på bordet; valget er dit.
- Gen-sætsanrigelsesanalyse (GSEA)Bioinformatik↔ sammenlign
- Multi-omics gen-sætsanrigelsesanalyseBioinformatik↔ sammenlign
- Pathway Enrichment AnalysisBioinformatik↔ sammenlign
- RNA-seq Differential ExpressionBioinformatik↔ sammenlign
- Single-cell RNA-seq AnalyseBioinformatik↔ sammenlign
- Tidsserie RNA-seq differentiel ekspressionBioinformatik↔ sammenlign
Similar methods
Har du fundet en fejl på denne side? Indberet den eller foreslå en rettelse →