Netværksbaseret GWAS — Netværksbaseret Genom-dækkende Associationsstudie
Netværksbaseret GWAS integrerer resultater fra konventionelle genom-dækkende associationsstudier med biologiske netværksdata — såsom protein-protein-interaktionsnetværk (PPI) eller gen-koekspressionsgrafer — for at identificere sygdomsrelevante genmoduler eller subnetværk. I stedet for kun at rapportere de øverste individuelle SNP'er, propagere denne tilgang associationssignaler gennem molekylære interaktionsnetværk, hvilket fremhæver genklynger, hvis kollektive signal implicerer dem i kompleks-trækbiologi, selv når ingen enkelt variant alene når genom-dækkende signifikans.
Læs hele metoden
Log ind med en gratis konto for at læse dette afsnit.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Kilder
- Wang, Q., Yu, H., Zhao, Z., & Jia, P. (2015). EW_dmGWAS: edge-weighted dense module search for genome-wide association studies and gene expression profiles. Bioinformatics, 31(15), 2591–2594. link ↗
- Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations contributing to tumorigenesis. Nature Genetics, 47(2), 106–114. link ↗
Sådan citerer du denne side
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Genome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/da/bioinformatics/network-based-gwas
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Analyse af kopitalvariansBioinformatik↔ compare
- eQTL-analyseBioinformatik↔ compare
- Gen-sætsanrigelsesanalyse (GSEA)Bioinformatik↔ compare
- Genomdækkende associationsstudie (GWAS)Bioinformatik↔ compare
- Netværksbaseret eQTL-analyseBioinformatik↔ compare
- Pathway Enrichment AnalysisBioinformatik↔ compare
Refereret af
Har du fundet en fejl på denne side? Indberet den eller foreslå en rettelse →