Tidsrækkeanalyse af enkeltcelle-RNA-sekventering — Temporal transskriptomik med enkeltcelleopløsning
Tidsrækkeanalyse af enkeltcelle-RNA-sekventering (scRNA-seq) indsamler genekspression på tværs af flere tidspunkter med enkeltcelleopløsning for at afsløre, hvordan cellepopulationer opstår, overgår og divergerer under dynamiske biologiske processer som udvikling, differentiering eller sygdomsprogression. Ved at kombinere pseudotidsordning, RNA-hastighed og test af differentiel dynamik rekonstruerer forskere den temporale bane for individuelle celler og identificerer de genregulatoriske ændringer, der driver biologiske overgange.
Læs hele metoden
Log ind med en gratis konto for at læse dette afsnit.
Metodekort
Nabolaget af beslægtede metoder — vælg en knude for at udforske.
Kilder
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., Lidschreiber, K., Kastriti, M. E., Lonnerberg, P., Furlan, A., Fan, J., Borm, L. E., Liu, Z., van Bruggen, D., Guo, J., He, X., Linnarsson, S., & Kharchenko, P. V. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7719), 494-498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
Sådan citerer du denne side
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/da/bioinformatics/time-series-single-cell-rna-seq-analysis
Hvilken metode?
Stil denne metode ved siden af dens nærmeste slægtninge, og læs dem side om side — biblioteket lægger bøgerne på bordet; valget er dit.
- Analyse af kopitalvariansBioinformatik↔ sammenlign
- eQTL-analyseBioinformatik↔ sammenlign
- Gen-sætsanrigelsesanalyse (GSEA)Bioinformatik↔ sammenlign
- Pathway Enrichment AnalysisBioinformatik↔ sammenlign
- RNA-seq Differential ExpressionBioinformatik↔ sammenlign
- Single-cell RNA-seq AnalyseBioinformatik↔ sammenlign
Refereret af
Har du fundet en fejl på denne side? Indberet den eller foreslå en rettelse →