Netværksbaseret berigelsesanalyse af signalveje
Netværksbaseret berigelsesanalyse af signalveje integrerer molekylære interaktionsnetværk – protein-protein-interaktioner, signaleringsgrafer eller genregulerende netværk – med omics-målinger for at identificere biologiske signalveje, der koordineret er ændret under en given tilstand. I modsætning til klassiske overrepræsentations- eller gen-sæt-berigelsesmetoder, der behandler signalvejsgener som uafhængige lister, propagerer denne familie af metoder signaler på tværs af netværkskanter, fanger interaktionernes topologi og afdækker dysregulerede moduler, som flad-liste-berigelse ville overse.
Læs hele metoden
Log ind med en gratis konto for at læse dette afsnit.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Kilder
- Ideker, T., Ozier, O., Schwikowski, B., & Siegel, A. F. (2002). Discovering regulatory and signalling circuits in molecular interaction networks. Bioinformatics, 18(suppl_1), S233–S240. link ↗
- Vaske, C. J., Benz, S. C., Sanborn, J. Z., Earl, D., Szeto, C., Zhu, J., Haussler, D., & Stuart, J. M. (2010). Inference of patient-specific pathway activities from multi-dimensional cancer genomics data using PARADIGM. Bioinformatics, 26(12), i237–i245. DOI: 10.1093/bioinformatics/btq182 ↗
Sådan citerer du denne side
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/da/bioinformatics/network-based-pathway-enrichment-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Gen-sætsanrigelsesanalyse (GSEA)Bioinformatik↔ compare
Refereret af
Har du fundet en fejl på denne side? Indberet den eller foreslå en rettelse →