ScholarGate
Asisten

Bioinformatika

112 metode dalam keluarga ini.

Unggulan

Analisis AdmiskiAdmixture analysis is a population genetics method that infers population structure and individual ancestry from multilocus genotype data. Originally developed by Pritchard, StepheRekonstruksi Keadaan LeluhurAncestral state reconstruction (ASR) is a phylogenetic method that infers the character states (trait values or evolutionary features) of extinct ancestors by analyzing patterns ofAnalisis ATAC-seqATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) is a method for profiling the landscape of chromatin accessibility genome-wide. Developed by Buenrostro and cPanggilan Puncak ChIP-seqChIP-seq peak calling is a computational pipeline that identifies genomic regions where a protein of interest — a transcription factor or histone modification — is enriched, based Teori KoalesenCoalescent theory is a probabilistic framework that traces the genealogical history of DNA sequences backward in time to their most recent common ancestor. Developed by John KingmaAnalisis Variasi Jumlah SalinanCopy number variation (CNV) analysis is a genomic pipeline for detecting regions where individuals carry fewer or more copies of a DNA segment than the reference genome. CNVs span

Jalur bacaan

Metode fondasional yang paling banyak dirujuk pada topik ini, dalam urutan pengembangannya — tempat untuk memulai jika Anda baru di sini.

  1. Analisis Variasi Jumlah Salinan1998–2006oleh Pinkel et al. (array CGH); Redon et al. (genome-wide CNV map)
  2. Analisis Pengayaan Jalur2003–2005oleh Mootha et al. (2003); systematised by Subramanian et al. (2005)
  3. Analisis Pengayaan Set Gen (GSEA)2005 (seminal PNAS paper; predecessor concept in Mootha et al. 2003)oleh Aravind Subramanian, Pablo Tamayo, Vamsi K. Mootha, Jill P. Mesirov, Todd R. Golub, Eric S. Lander et al. (Broad Institute)
  4. Studi Asosiasi Seluruh Genom (GWAS)2005–2007oleh Klein et al. (age-related macular degeneration GWAS, 2005); landmark scale: Wellcome Trust Case Control Consortium (2007)
  5. Studi Asosiasi Seluruh Epigenom (EWAS)2008–2011 (term and framework established c. 2011)oleh Rakyan, Down, Balding & Beck (conceptual framework); Illumina arrays enabled large-scale application
  6. Analisis Ekspresi Diferensial RNA-seq2008–2010 (RNA-seq DE methodology established)oleh Multiple groups; foundational methods from Anders & Huber (DESeq, 2010), Robinson, McCarthy & Smyth (edgeR, 2010)
  7. Analisis RNA-seq Sel Tunggal2009 (first scRNA-seq by Tang et al.); widely adopted 2015–2016oleh Azim Surani, Barbara Treutlein, and the Regev/McCarroll groups (foundational droplet-based methods ~2015)
  8. Panggilan Varian2009–2010 (modern high-throughput era)oleh Li et al. (SAMtools/bcftools, 2009); McKenna et al. (GATK, 2010)
semua metode di rak ini ↓

Semua metode 112

Analisis AdmiskiRekonstruksi Keadaan LeluhurAnalisis ATAC-seqPanggilan Puncak ChIP-seqTeori KoalesenAnalisis Variasi Jumlah SalinanAnalisis Skrining CRISPRRekonstruksi Krio-EMPerakitan Transkriptom De NovoPemanggilan Puncak ChIP-seq DiferensialAnalisis Variasi Jumlah Salinan DiferensialStudi Asosiasi Seluruh EpigenomAnalisis eQTL DiferensialAnalisis Metabolomika DiferensialAnalisis Pengayaan Jalur DiferensialAnalisis Proteomik DiferensialAnalisis RNA-seq Sel Tunggal DiferensialPemanggilan Varian DiferensialStudi Asosiasi Seluruh Epigenom (EWAS)Studi Asosiasi Seluruh Epigenom dalam Riset PendidikanAnalisis eQTLStatistik F (FST)GCTAAnalisis Pengayaan Set Gen (GSEA)Studi Asosiasi Seluruh Genom (GWAS)Studi Asosiasi Seluruh Genom dalam Riset PendidikanAnalisis Hi-CTes HKAPencarian Profil HMMERPemodelan HomologiPemetaan IBDAnalisis Blok LDPemanggilan Puncak ChIP-seq Berbantuan Pembelajaran MesinAnalisis Variasi Jumlah Salinan Dibantu Pembelajaran MesinStudi Asosiasi Epigenom-Luas Berbantuan ML (ML-EWAS)Analisis eQTL Berbantuan Pembelajaran MesinAnalisis Pengayaan Himpunan Gen Berbantuan Pembelajaran MesinStudi Asosiasi Seluruh Genom Berbantuan Pembelajaran MesinAnalisis Metabolomik Berbantuan Pembelajaran MesinAnalisis Keanekaragaman Mikrobioma Berbantuan Pembelajaran MesinAnalisis Pengayaan Jalur yang Dibantu Pembelajaran MesinAnalisis Filogenetik Berbantuan Pembelajaran MesinAnalisis Ekspresi Diferensial RNA-seq Berbantuan Pembelajaran MesinPenjajaran Urutan Berbantuan Pembelajaran MesinAnalisis RNA-seq Sel Tunggal Berbantuan Pembelajaran MesinPemanggilan Varian Berbantuan Pembelajaran MesinUji McDonald-KreitmanAnalisis MetabolomikPembagian MetagenomikPenambatan MolekulerStudi Asosiasi Epigenom-Luas Multi-OmikAnalisis eQTL Multi-OmikAnalisis Pengayaan Set Gen Multi-OmikAnalisis Metabolomik Multi-OmikAnalisis Keanekaragaman Mikrobioma Multi-OmikAnalisis Pengayaan Jalur Multi-OmikAnalisis Filogenetik Multi-OmikAnalisis proteomik multi-omikAnalisis Ekspresi Diferensial RNA-seq Multi-OmikAnalisis RNA-sel Tunggal Multi-omikAnalisis Variasi Jumlah Salinan Berbasis JaringanStudi Asosiasi Epigenom-Seluruh Jaringan (Network EWAS)Analisis eQTL Berbasis JaringanGWAS Berbasis JaringanAnalisis Metabolomik Berbasis JaringanAnalisis Keanekaragaman Mikrobioma Berbasis JaringanAnalisis Pengayaan Jalur Berbasis JaringanAnalisis Filogenetik Berbasis JaringanAnalisis Ekspresi Diferensial RNA-seq Berbasis JaringanAnalisis RNA-seq Sel Tunggal Berbasis JaringanPemanggilan Varian Berbasis JaringanAnalisis Pengayaan JalurPemodelan FarmakoforAnalisis FilogenetikPhylogenetic Independent ContrastsSkor Risiko PoligenikTopologi Jaringan Interaksi Protein-ProteinAnalisis ProteomikQSARPemetaan QTLRNA VelocityAnalisis Ekspresi Diferensial RNA-seqSelection Sweep (Tajima's D)Perataan UrutanPemanggilan Puncak ChIP-seq Sel TunggalAnalisis Variasi Jumlah Salinan Sel TunggalStudi Asosiasi Seluruh Epigenom Skala Sel Tunggal (scEWAS)Analisis eQTL Sel TunggalAnalisis Pengayaan Himpunan Gen Sel TunggalAnalisis Asosiasi Genetik Spesifik Tipe Sel Single-cell GWASAnalisis Metabolomik Sel TunggalAnalisis Keanekaragaman Mikrobioma Sel TunggalAnalisis Filogenetik Sel TunggalAnalisis RNA-seq Sel TunggalAnalisis Ekspresi Diferensial Ekspresi Gen RNA-seq Sel TunggalPenjajaran Urutan Sel TunggalPemanggilan varian sel tunggalPencocokan Puncak ChIP-seq Deret WaktuAnalisis Variasi Jumlah Salinan Deret WaktuStudi Asosiasi Epigenom-Luas Deret WaktuAnalisis eQTL Deret WaktuAnalisis Pengayaan Himpunan Gen Deret WaktuAnalisis Metabolomik Deret WaktuAnalisis Keanekaragaman Mikrobioma Deret WaktuAnalisis Pengayaan Jalur Deret WaktuAnalisis Filogenetik Deret WaktuAnalisis Proteomik Deret WaktuAnalisis Ekspresi Diferensial RNA-seq Deret WaktuAnalisis RNA-seq Sel Tunggal Deret WaktuPanggilan Varian Deret WaktuUji Keseimbangan TransmisiPanggilan Varian

Lainnya di Pemrosesan Sinyal dan Komputasi Ilmiah

Sinyal dan numerik 48