Analisis Pengayaan Set Gen (GSEA)
Analisis Pengayaan Set Gen (GSEA) adalah metode komputasi yang menentukan apakah sekumpulan gen yang telah ditentukan sebelumnya — mewakili jalur biologis, proses, atau fungsi — menunjukkan perbedaan terkoordinasi yang signifikan secara statistik antara dua kondisi biologis. Berbeda dengan pemfilteran perubahan lipat sederhana, GSEA beroperasi pada semua gen yang terukur yang diberi peringkat berdasarkan metrik korelasi, mendeteksi pergeseran halus namun konsisten di seluruh jalur bahkan ketika tidak ada gen tunggal yang melewati ambang signifikansi.
Baca metode selengkapnya
Masuk dengan akun gratis untuk membaca bagian ini.
Peta metode
Lingkup metode terkait — pilih sebuah simpul untuk menjelajah.
+27 lainnya
Sumber
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Mootha, V. K., Lindgren, C. M., Eriksson, K. F., Subramanian, A., Sihag, S., Lehar, J., Puigserver, P., Carlsson, E., Ridderstrale, M., Laurila, E., Houstis, N., Daly, M. J., Patterson, N., Mesirov, J. P., Golub, T. R., Tamayo, P., Spiegelman, B., Lander, E. S., Hirschhorn, J. N., Altshuler, D., & Groop, L. C. (2003). PGC-1alpha-responsive genes involved in oxidative phosphorylation are coordinately downregulated in human diabetes. Nature Genetics, 34(3), 267–273. DOI: 10.1038/ng1180 ↗
Cara menyitasi halaman ini
ScholarGate. (2026, June 3). Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/id/bioinformatics/gene-set-enrichment-analysis
Metode yang mana?
Letakkan metode ini berdampingan dengan kerabat terdekatnya dan baca secara bersisian — pustaka menata bukunya di atas meja; pilihan ada di tangan Anda.
- Analisis Pengayaan Set Gen Multi-OmikBioinformatika↔ bandingkan
- Analisis Pengayaan Himpunan Gen Berbasis JaringanBioinformatika↔ bandingkan
- Analisis Pengayaan JalurBioinformatika↔ bandingkan
- Analisis Ekspresi Diferensial RNA-seqBioinformatika↔ bandingkan
- Analisis RNA-seq Sel TunggalBioinformatika↔ bandingkan
Dirujuk oleh
Similar methods
Menemukan masalah di halaman ini? Laporkan atau usulkan perbaikan →