Pembagian Metagenomik
Pembagian metagenomik mempartisi kontig yang dirakit dari komunitas mikroba kompleks menjadi bin genom yang berbeda, masing-masing mewakili organisme atau strain individu. Dipelopori oleh Banfield dan rekan-rekannya, alur kerja ini mengisolasi genom organisme tunggal (genom yang dirakit dari metagenom atau MAG) dari sampel lingkungan tanpa memerlukan isolat yang dikultur.
Baca metode selengkapnya
Masuk dengan akun gratis untuk membaca bagian ini.
Peta metode
Lingkup metode terkait — pilih sebuah simpul untuk menjelajah.
Sumber
- Kang, D. D., Froula, J., Egan, R., & Wang, Z. (2015). MetaBAT, an efficient tool for accurately reconstructing single genomes from complex microbial communities. PeerJ, 3, e1165. DOI: 10.7717/peerj.1165 ↗
- Jain, C., Rodriguez-R, L. M., Phillippy, A. M., Konstantinidis, K. T., & Aluru, S. (2018). High throughput ANI analysis of 90K prokaryotic genomes reveals clear species boundaries. Nature Communications, 9(1), 4045. DOI: 10.1038/s41467-018-07641-9 ↗
- Sieber, C. M. K., Probst, A. J., Sharrar, A., Thomas, B. C., Hess, M., Tringe, S. G., & Banfield, J. F. (2018). Recovery of genomes from metagenomes via a dereplication, aggregation and scoring strategy. Nature Microbiology, 3(7), 836-843. DOI: 10.1038/s41564-018-0171-1 ↗
Cara menyitasi halaman ini
ScholarGate. (2026, June 3). Metagenome Assembly and Genome Binning. ScholarGate. https://scholargate.app/id/bioinformatics/metagenomic-binning
Metode yang mana?
Letakkan metode ini berdampingan dengan kerabat terdekatnya dan baca secara bersisian — pustaka menata bukunya di atas meja; pilihan ada di tangan Anda.
- Analisis Skrining CRISPRBioinformatika↔ bandingkan
- Perakitan Transkriptom De NovoBioinformatika↔ bandingkan
- Pencarian Profil HMMERBioinformatika↔ bandingkan
Dirujuk oleh
Similar methods
Menemukan masalah di halaman ini? Laporkan atau usulkan perbaikan →