Analisis Pengayaan Himpunan Gen Deret Waktu — Pengayaan Jalur Dinamis Melintasi Titik Waktu
Analisis pengayaan himpunan gen deret waktu (TS-GSEA) memperluas kerangka kerja GSEA klasik untuk mendeteksi himpunan gen yang terkoordinasi secara biologis — jalur, istilah ontologi gen, atau tanda tangan yang dikurasi — yang perubahan ekspresinya secara kolektif bermakna dari waktu ke waktu. Alih-alih membandingkan dua cuplikan, metode ini memodelkan lintasan temporal penuh ekspresi gen untuk mengidentifikasi program fungsional mana yang diaktifkan, ditekan, atau diremodel secara dinamis selama proses biologis seperti perkembangan, respons pengobatan, atau progresi penyakit.
Baca metode selengkapnya
Masuk dengan akun gratis untuk membaca bagian ini.
Peta metode
Lingkup metode terkait — pilih sebuah simpul untuk menjelajah.
Sumber
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Nueda, M. J., Tarazona, S., & Conesa, A. (2014). Next maSigPro: updating maSigPro bioconductor package for RNA-seq time series. Bioinformatics, 30(18), 2598–2602. DOI: 10.1093/bioinformatics/btu333 ↗
Cara menyitasi halaman ini
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/id/bioinformatics/time-series-gene-set-enrichment-analysis
Metode yang mana?
Letakkan metode ini berdampingan dengan kerabat terdekatnya dan baca secara bersisian — pustaka menata bukunya di atas meja; pilihan ada di tangan Anda.
- Analisis Pengayaan Set Gen (GSEA)Bioinformatika↔ bandingkan
- Analisis Pengayaan Set Gen Multi-OmikBioinformatika↔ bandingkan
- Analisis Pengayaan JalurBioinformatika↔ bandingkan
- Analisis Ekspresi Diferensial RNA-seqBioinformatika↔ bandingkan
- Analisis RNA-seq Sel TunggalBioinformatika↔ bandingkan
- Analisis Ekspresi Diferensial RNA-seq Deret WaktuBioinformatika↔ bandingkan
Similar methods
Menemukan masalah di halaman ini? Laporkan atau usulkan perbaikan →