Analisis Pengayaan Jalur Berbasis Jaringan
Analisis pengayaan jalur berbasis jaringan mengintegrasikan jaringan interaksi molekuler — interaksi protein-protein, graf pensinyalan, atau jaringan regulasi gen — dengan pengukuran omics untuk mengidentifikasi jalur biologis yang secara terkoordinasi berubah dalam suatu kondisi. Berbeda dengan pendekatan klasik over-representation atau gene-set enrichment yang memperlakukan gen jalur sebagai daftar independen, keluarga metode ini menyebarkan sinyal melintasi tepi jaringan, menangkap topologi interaksi dan mengungkap modul yang terdisregulasi yang akan terlewatkan oleh pengayaan daftar datar.
Baca metode selengkapnya
Masuk dengan akun gratis untuk membaca bagian ini.
Peta metode
Lingkup metode terkait — pilih sebuah simpul untuk menjelajah.
Sumber
- Ideker, T., Ozier, O., Schwikowski, B., & Siegel, A. F. (2002). Discovering regulatory and signalling circuits in molecular interaction networks. Bioinformatics, 18(suppl_1), S233–S240. link ↗
- Vaske, C. J., Benz, S. C., Sanborn, J. Z., Earl, D., Szeto, C., Zhu, J., Haussler, D., & Stuart, J. M. (2010). Inference of patient-specific pathway activities from multi-dimensional cancer genomics data using PARADIGM. Bioinformatics, 26(12), i237–i245. DOI: 10.1093/bioinformatics/btq182 ↗
Cara menyitasi halaman ini
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/id/bioinformatics/network-based-pathway-enrichment-analysis
Metode yang mana?
Letakkan metode ini berdampingan dengan kerabat terdekatnya dan baca secara bersisian — pustaka menata bukunya di atas meja; pilihan ada di tangan Anda.
- Analisis Pengayaan Set Gen (GSEA)Bioinformatika↔ bandingkan
Dirujuk oleh
Menemukan masalah di halaman ini? Laporkan atau usulkan perbaikan →