Pencarian Profil HMMER
Pencarian profil HMMER mengidentifikasi homolog urutan protein yang jauh menggunakan model probabilistik keluarga protein, yang dikenal sebagai Model Markov Tersembunyi profil (HMM). Dikembangkan oleh Eddy dan rekan-rekannya, metode ini menangkap pola variasi urutan dalam keluarga protein dan mendeteksi homolog dengan sensitivitas yang jauh lebih besar daripada matriks bobot posisi atau penyelarasan berpasangan.
Baca metode selengkapnya
Masuk dengan akun gratis untuk membaca bagian ini.
Peta metode
Lingkup metode terkait — pilih sebuah simpul untuk menjelajah.
Sumber
- Krogh, A., Brown, M., Mian, I. S., Sjölander, K., & Haussler, D. (1994). Hidden Markov models in computational biology: applications to protein modeling. Journal of Molecular Biology, 235(5), 1501-1531. DOI: 10.1006/jmbi.1994.1104 ↗
- Eddy, S. R. (1998). Profile hidden Markov models. Bioinformatics, 14(9), 755-763. DOI: 10.1093/bioinformatics/14.9.755 ↗
- Finn, R. D., Clements, J., & Eddy, S. R. (2011). HMMER web server: interactive sequence similarity searching. Nucleic Acids Research, 39(Web Server issue), W29-W37. DOI: 10.1093/nar/gkr367 ↗
Cara menyitasi halaman ini
ScholarGate. (2026, June 3). Hidden Markov Model Profile Search for Sequence Homology. ScholarGate. https://scholargate.app/id/bioinformatics/hmmer-profile-search
Metode yang mana?
Letakkan metode ini berdampingan dengan kerabat terdekatnya dan baca secara bersisian — pustaka menata bukunya di atas meja; pilihan ada di tangan Anda.
- Rekonstruksi Krio-EMBioinformatika↔ bandingkan
- Pembagian MetagenomikBioinformatika↔ bandingkan
- Penambatan MolekulerBioinformatika↔ bandingkan
Dirujuk oleh
Menemukan masalah di halaman ini? Laporkan atau usulkan perbaikan →