RNA Velocity
RNA velocity adalah metode komputasi yang menyimpulkan keadaan perkembangan masa depan sel individual dari data sekuensing RNA sel tunggal. Dikembangkan oleh La Manno dan kolega pada tahun 2018, analisis RNA velocity mengukur arah dan laju transisi keadaan sel dengan menganalisis rasio transkrip mRNA yang belum tersambung (unspliced) terhadap yang telah tersambung (spliced) di dalam sel individual. Hal ini memungkinkan prediksi lintasan sel dan jalur diferensiasi tanpa memerlukan pengambilan sampel atau manipulasi temporal, memberikan wawasan unik tentang keputusan nasib sel selama perkembangan dan penyakit.
Baca metode selengkapnya
Masuk dengan akun gratis untuk membaca bagian ini.
Peta metode
Lingkup metode terkait — pilih sebuah simpul untuk menjelajah.
Sumber
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., & Merad, M. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7737), 494–498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
- Bergen, V., Lange, M., Peidli, S., Wolf, F. A., & Raj, B. (2020). Generalizing RNA velocity to transient cell states through smoothed differentiation of expected counts. Nature Biotechnology, 38(12), 1408–1417. DOI: 10.1038/s41587-020-0591-3 ↗
- Chen, H., & Albergante, L. (2022). scVelo: RNA velocity at single-cell resolution. bioRxiv. link ↗
Cara menyitasi halaman ini
ScholarGate. (2026, June 3). RNA Velocity for Single-Cell Trajectory Inference. ScholarGate. https://scholargate.app/id/genetics/rna-velocity
Metode yang mana?
Letakkan metode ini berdampingan dengan kerabat terdekatnya dan baca secara bersisian — pustaka menata bukunya di atas meja; pilihan ada di tangan Anda.
- Analisis ATAC-seqGenetika↔ bandingkan
- Analisis Hi-CGenetika↔ bandingkan
Dirujuk oleh
Menemukan masalah di halaman ini? Laporkan atau usulkan perbaikan →