Analisis Pengayaan Himpunan Gen Sel Tunggal — scGSEA
Analisis pengayaan himpunan gen sel tunggal (scGSEA) memperluas GSEA klasik ke resolusi sel individual. Alih-alih menguji apakah suatu himpunan gen diperkaya dalam perbandingan tingkat sampel, scGSEA menetapkan skor pengayaan atau aktivitas untuk setiap sel, memungkinkan peneliti memetakan aktivitas jalur di seluruh populasi sel yang heterogen, keadaan sel, dan lintasan perkembangan yang ditangkap dalam data RNA-seq sel tunggal.
Baca metode selengkapnya
Masuk dengan akun gratis untuk membaca bagian ini.
Peta metode
Lingkup metode terkait — pilih sebuah simpul untuk menjelajah.
Sumber
- Aibar, S., Gonzalez-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., Rambow, F., Marine, J.-C., Geurts, P., Aerts, J., van den Oord, J., Kalender Atak, Z., Wouters, J., & Aerts, S. (2017). SCENIC: Single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083-1086. link ↗
- DeTomaso, D., Jones, M. G., Subramaniam, M., Ashuach, T., Ye, C. J., & Yosef, N. (2019). Functional interpretation of single cell similarity maps. Nature Communications, 10(1), 4376. link ↗
Cara menyitasi halaman ini
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/id/bioinformatics/single-cell-gene-set-enrichment-analysis
Metode yang mana?
Letakkan metode ini berdampingan dengan kerabat terdekatnya dan baca secara bersisian — pustaka menata bukunya di atas meja; pilihan ada di tangan Anda.
- Analisis Pengayaan Set Gen (GSEA)Bioinformatika↔ bandingkan
- Analisis Pengayaan JalurBioinformatika↔ bandingkan
- Analisis Ekspresi Diferensial RNA-seqBioinformatika↔ bandingkan
- Analisis RNA-seq Sel TunggalBioinformatika↔ bandingkan
- Analisis Ekspresi Diferensial Ekspresi Gen RNA-seq Sel TunggalBioinformatika↔ bandingkan
Dirujuk oleh
Similar methods
Menemukan masalah di halaman ini? Laporkan atau usulkan perbaikan →