Analisis Hi-C
Hi-C (High-Chromosome Conformation Capture) adalah teknik dan metode komputasi terkait untuk memetakan arsitektur 3D genom di dalam sel. Dikembangkan oleh Lieberman-Aiden dan Dekker pada tahun 2009, Hi-C mengidentifikasi interaksi fisik antara wilayah genomik yang mungkin berjauhan dalam urutan linier tetapi berdekatan secara spasial dalam ruang nukleus 3D. Analisis Hi-C telah mengungkap prinsip-prinsip fundamental organisasi genom, termasuk keberadaan domain yang berasosiasi secara topologis (TAD), dan memberikan wawasan tentang bagaimana struktur 3D mengatur ekspresi gen dan replikasi DNA.
Baca metode selengkapnya
Masuk dengan akun gratis untuk membaca bagian ini.
Peta metode
Lingkup metode terkait — pilih sebuah simpul untuk menjelajah.
Sumber
- Lieberman-Aiden, E., van Berkum, N. L., Williams, L., Imakaev, M., Ragoczy, T., Telling, A., & Dekker, J. (2009). Comprehensive mapping of long-range interactions reveals folding principles of the human genome. Science, 326(5950), 289–293. DOI: 10.1126/science.1181369 ↗
- Dixon, J. R., Selvaraj, S., Yue, F., Kim, A., Li, Y., Shen, Y., & Ren, B. (2012). Topological domains in mammalian genomes identified by analysis of chromatin interactions. Nature, 485(7398), 376–380. DOI: 10.1038/nature11082 ↗
- Szabo, Q., Bantignies, F., & Cavalli, G. (2019). 3D chromatin architecture. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 20(4), 207–220. link ↗
Cara menyitasi halaman ini
ScholarGate. (2026, June 3). Hi-C Analysis of 3D Genome Organization and Chromatin Interactions. ScholarGate. https://scholargate.app/id/genetics/hi-c-analysis
Metode yang mana?
Letakkan metode ini berdampingan dengan kerabat terdekatnya dan baca secara bersisian — pustaka menata bukunya di atas meja; pilihan ada di tangan Anda.
- Analisis ATAC-seqGenetika↔ bandingkan
- RNA VelocityGenetika↔ bandingkan
Dirujuk oleh
Menemukan masalah di halaman ini? Laporkan atau usulkan perbaikan →