Analisis ATAC-seq
ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) adalah metode untuk memprofilkan lanskap aksesibilitas kromatin di seluruh genom. Dikembangkan oleh Buenrostro dan kolega pada tahun 2013, ATAC-seq menggunakan transposase yang sangat aktif untuk menandai daerah kromatin yang terbuka dan dapat diakses, memungkinkan identifikasi elemen DNA regulatorik yang cepat dan sensitif. ATAC-seq telah menjadi teknik standar untuk mengkarakterisasi lanskap regulatorik gen, menemukan elemen regulatorik spesifik tipe sel, dan menyimpulkan jaringan regulatorik gen.
Baca metode selengkapnya
Masuk dengan akun gratis untuk membaca bagian ini.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Sumber
- Buenrostro, J. D., Giresi, P. G., Zaba, L. C., Chang, H. Y., & Greenleaf, W. J. (2013). Transposition of native chromatin for fast and sensitive epigenomic profiling of cell populations and tissues. Nature Methods, 10(12), 1213–1218. link ↗
- Corces, M. R., Buenrostro, J. D., Wu, B., Greenside, P. G., Chan, S. M., Koenig, J. L., & Greenleaf, W. J. (2017). Lineage-specific and single-cell chromatin accessibility charts human hematopoiesis. Nature Genetics, 48(10), 1193–1203. DOI: 10.1038/ng.3646 ↗
- Satpathy, A. T., Granja, J. M., Yost, K. E., Qi, Y., Meschi, F., McDermott, G. P., & Chang, H. Y. (2019). Massively parallel single-cell chromatin landscapes. Nature Biotechnology, 37(12), 1452–1462. link ↗
Cara menyitasi halaman ini
ScholarGate. (2026, June 3). ATAC-seq Analysis for Chromatin Accessibility and Regulatory Landscapes. ScholarGate. https://scholargate.app/id/genetics/atac-seq-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Analisis Hi-CGenetika↔ compare
- RNA VelocityGenetika↔ compare
Dirujuk oleh
Menemukan masalah di halaman ini? Laporkan atau usulkan perbaikan →