Analisis Filogenetik Sel Tunggal — Rekonstruksi Pohon Keturunan pada Resolusi Sel Tunggal
Analisis filogenetik sel tunggal merekonstruksi pohon evolusioner atau perkembangan dari data sekuensing sel tunggal, melacak bagaimana sel-sel individual berdiversifikasi dari nenek moyang yang sama. Dengan memanfaatkan mutasi somatik, barcode yang diperkenalkan CRISPR, atau perubahan jumlah salinan sebagai karakter yang dapat diwariskan, metode ini memetakan hubungan klonal dalam tumor, jaringan yang berkembang, atau repertoar imun dengan resolusi sel yang belum pernah terjadi sebelumnya.
Baca metode selengkapnya
Masuk dengan akun gratis untuk membaca bagian ini.
Peta metode
Lingkup metode terkait — pilih sebuah simpul untuk menjelajah.
Sumber
- Jones, M. G., Khodaverdian, A., Quinn, J. J., Chan, M. M., Hussmann, J. A., Wang, R., Xu, C., Weissman, J. S., & Yosef, N. (2020). Inference of single-cell phylogenies from lineage tracing data using Cassiopeia. Genome Biology, 21(1), 92. DOI: 10.1186/s13059-020-02000-8 ↗
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
Cara menyitasi halaman ini
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Phylogenetic and Lineage Tree Reconstruction. ScholarGate. https://scholargate.app/id/bioinformatics/single-cell-phylogenetic-analysis
Metode yang mana?
Letakkan metode ini berdampingan dengan kerabat terdekatnya dan baca secara bersisian — pustaka menata bukunya di atas meja; pilihan ada di tangan Anda.
- Analisis Variasi Jumlah SalinanBioinformatika↔ bandingkan
- Analisis FilogenetikBioinformatika↔ bandingkan
- Analisis RNA-seq Sel TunggalBioinformatika↔ bandingkan
- Panggilan VarianBioinformatika↔ bandingkan
Menemukan masalah di halaman ini? Laporkan atau usulkan perbaikan →