Panggilan Varian Deret Waktu — Deteksi Mutasi Somatik Longitudinal

Panggilan varian deret waktu adalah sebuah alur kerja bioinformatika yang mengidentifikasi dan melacak varian genomik — biasanya mutasi somatik — melintasi beberapa sampel sekuensing yang dikumpulkan dari subjek yang sama pada titik waktu yang berbeda. Metode ini paling luas diterapkan dalam genomik kanker untuk merekonstruksi evolusi tumor, memantau penyakit residual minimal, dan mendeteksi munculnya klon yang resisten terhadap terapi. Dengan memodelkan frekuensi alel varian secara bersamaan melintasi dimensi temporal, metode ini membedakan perubahan somatik sejati dari derau sekuensing dan memperkirakan dinamika klonal dari waktu ke waktu.