Analisi Bayesiana della Diversità del Microbioma — Valutazione Probabilistica della Struttura della Comunità
L'analisi Bayesiana della diversità del microbioma applica modelli probabilistici — principalmente Dirichlet-Multinomial e framework gerarchici correlati — a dati di conteggio da sequenziamento 16S rRNA o metagenomico shotgun per stimare l'alpha-diversità (ricchezza ed equità intra-campione) e la beta-diversità (differenze composizionali inter-campione), propagando al contempo l'incertezza attraverso l'intera catena inferenziale. A differenza degli approcci frequentisti basati sulla rarefazione, i metodi Bayesiani trattano i conteggi dei taxa come estrazioni da una composizione latente, consentendo intervalli di credibilità sulle metriche di diversità e confronti basati su principi tra gruppi con profondità di sequenziamento disuguali.
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Fonti
- Holmes, I., Harris, K., & Quince, C. (2012). Dirichlet Multinomial Mixtures: Generative Models for Microbial Metagenomics. PLOS ONE, 7(2), e30126. link ↗
- La Rosa, P. S., Brooks, J. P., Deych, E., Boone, E. L., Edwards, D. J., Wang, Q., Sodergren, E., Weinstock, G., & Shannon, W. D. (2012). Hypothesis Testing and Power Calculations for Taxonomic-Based Human Microbiome Data. PLOS ONE, 7(12), e52078. link ↗
Come citare questa pagina
ScholarGate. (2026, June 3). Bayesian Statistical Analysis of Microbiome Diversity. ScholarGate. https://scholargate.app/it/bioinformatics/bayesian-microbiome-diversity-analysis
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