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Analisi Bayesiana della Diversità del Microbioma — Valutazione Probabilistica della Struttura della Comunità

L'analisi Bayesiana della diversità del microbioma applica modelli probabilistici — principalmente Dirichlet-Multinomial e framework gerarchici correlati — a dati di conteggio da sequenziamento 16S rRNA o metagenomico shotgun per stimare l'alpha-diversità (ricchezza ed equità intra-campione) e la beta-diversità (differenze composizionali inter-campione), propagando al contempo l'incertezza attraverso l'intera catena inferenziale. A differenza degli approcci frequentisti basati sulla rarefazione, i metodi Bayesiani trattano i conteggi dei taxa come estrazioni da una composizione latente, consentendo intervalli di credibilità sulle metriche di diversità e confronti basati su principi tra gruppi con profondità di sequenziamento disuguali.

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Fonti

  1. Holmes, I., Harris, K., & Quince, C. (2012). Dirichlet Multinomial Mixtures: Generative Models for Microbial Metagenomics. PLOS ONE, 7(2), e30126. link
  2. La Rosa, P. S., Brooks, J. P., Deych, E., Boone, E. L., Edwards, D. J., Wang, Q., Sodergren, E., Weinstock, G., & Shannon, W. D. (2012). Hypothesis Testing and Power Calculations for Taxonomic-Based Human Microbiome Data. PLOS ONE, 7(12), e52078. link

Come citare questa pagina

ScholarGate. (2026, June 3). Bayesian Statistical Analysis of Microbiome Diversity. ScholarGate. https://scholargate.app/it/bioinformatics/bayesian-microbiome-diversity-analysis

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ScholarGateBayesian Microbiome Diversity Analysis (Bayesian Statistical Analysis of Microbiome Diversity). Consultato il 2026-06-15 da https://scholargate.app/it/bioinformatics/bayesian-microbiome-diversity-analysis · Insieme di dati: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026