ScholarGate
Βοηθός

Βιοπληροφορική

112 μέθοδοι σε αυτή την οικογένεια.

Επιλεγμένες

Διαδρομή ανάγνωσης

Οι πιο πολυαναφερόμενες θεμελιώδεις μέθοδοι αυτού του θέματος, με τη σειρά που αναπτύχθηκαν — ένα σημείο εκκίνησης αν είστε νέος εδώ.

  1. Ανάλυση Μεταλλάξεων Αριθμού Αντιγράφων1998–2006από Pinkel et al. (array CGH); Redon et al. (genome-wide CNV map)
  2. Ανάλυση Εμπλουτισμού Βιολογικών Οδών2003–2005από Mootha et al. (2003); systematised by Subramanian et al. (2005)
  3. Ανάλυση Εμπλουτισμού Γονιδιακών Συνόλων (GSEA)2005 (seminal PNAS paper; predecessor concept in Mootha et al. 2003)από Aravind Subramanian, Pablo Tamayo, Vamsi K. Mootha, Jill P. Mesirov, Todd R. Golub, Eric S. Lander et al. (Broad Institute)
  4. Μελέτη Συσχέτισης σε Επίπεδο Γονιδιώματος (GWAS)2005–2007από Klein et al. (age-related macular degeneration GWAS, 2005); landmark scale: Wellcome Trust Case Control Consortium (2007)
  5. Μελέτη Συσχέτισης σε Επίπεδο Επιγονιδιώματος (EWAS)2008–2011 (term and framework established c. 2011)από Rakyan, Down, Balding & Beck (conceptual framework); Illumina arrays enabled large-scale application
  6. Ανάλυση Διαφορικής Έκφρασης RNA-seq2008–2010 (RNA-seq DE methodology established)από Multiple groups; foundational methods from Anders & Huber (DESeq, 2010), Robinson, McCarthy & Smyth (edgeR, 2010)
  7. Ανάλυση RNA-seq Μοναδιαίων Κυττάρων2009 (first scRNA-seq by Tang et al.); widely adopted 2015–2016από Azim Surani, Barbara Treutlein, and the Regev/McCarroll groups (foundational droplet-based methods ~2015)
  8. Variant Calling2009–2010 (modern high-throughput era)από Li et al. (SAMtools/bcftools, 2009); McKenna et al. (GATK, 2010)
όλες οι μέθοδοι σε αυτό το ράφι ↓

Όλες οι μέθοδοι 112

Ανάλυση ΕπιμειξίαςΑνακατασκευή Προγονικής ΚατάστασηςΑνάλυση ATAC-seqChIP-seq Peak CallingΘεωρία ΣυνένωσηςΑνάλυση Μεταλλάξεων Αριθμού ΑντιγράφωνΑνάλυση CRISPR ScreenΑνασύσταση με Κρυο-Ηλεκτρονική ΜικροσκοπίαΣυναρμολόγηση μεταγραφομικών δεδομένων de novoΔιαφορική Ανίχνευση Κορυφών ChIP-seqΑνάλυση Διαφορικής Μεταβολής Αριθμού ΑντιγράφωνΔιαφορική Μελέτη Συσχέτισης ΕπιγονιδιώματοςΔιαφορική Ανάλυση eQTLΑνάλυση Διαφορικής ΜεταβολομικήςΕμπλουτισμός Διαφορικών ΜονοπατιώνΔιαφορική Ανάλυση ΠρωτεωμικήςΔιαφορική Ανάλυση scRNA-seqΚλήση Διαφορικών ΠαραλλαγώνΜελέτη Συσχέτισης σε Επίπεδο Επιγονιδιώματος (EWAS)Epigenome-wide association study in educational researchΑνάλυση eQTLΣτατιστικές F (FST)GCTAΑνάλυση Εμπλουτισμού Γονιδιακών Συνόλων (GSEA)Μελέτη Συσχέτισης σε Επίπεδο Γονιδιώματος (GWAS)Μελέτη Συσχέτισης Γονιδιώματος (GWAS) στην Εκπαιδευτική ΈρευναΑνάλυση Hi-CΔοκιμή HKAΑναζήτηση Προφίλ HMMERΜοντελοποίηση ΟμολογίαςΧαρτογράφηση IBDΑνάλυση μπλοκ ανισορροπίας σύνδεσης (LD)Ανίχνευση κορυφών ChIP-seq με υποβοήθηση Μηχανικής ΜάθησηςΑνάλυση Μεταλλάξεων Αριθμού Αντιγράφων με Υποβοήθηση Μηχανικής ΜάθησηςΜελέτη Συσχέτισης Επιγονιδιώματος (ML-EWAS) με Υποβοήθηση Μηχανικής ΜάθησηςΑνάλυση eQTL με Υποβοήθηση Μηχανικής ΜάθησηςΑνάλυση Εμπλουτισμού Συνόλων Γονιδίων με Υποβοήθηση Μηχανικής ΜάθησηςGWAS με υποβοήθηση Μηχανικής ΜάθησηςΑνάλυση Μεταβολομικής με Υποβοήθηση Μηχανικής ΜάθησηςΑνάλυση Διαφορετικότητας Μικροβιώματος με Υποβοήθηση Μηχανικής ΜάθησηςΑνάλυση Εμπλουτισμού Μονοπατιών με Υποβοήθηση Μηχανικής ΜάθησηςΦυλογενετική Ανάλυση με Υποβοήθηση Μηχανικής ΜάθησηςΑνάλυση Διαφορικής Έκφρασης RNA-seq με Υποβοήθηση Μηχανικής ΜάθησηςΕυθυγράμμιση Ακολουθιών με Υποβοήθηση Μηχανικής ΜάθησηςΑνάλυση RNA-seq Μονοκυττάρων με Υποβοήθηση Μηχανικής ΜάθησηςΚλήση παραλλαγών με υποβοήθηση Μηχανικής ΜάθησηςMcDonald-Kreitman TestΜεταβολομική ΑνάλυσηΜεταγονιδιωματική ομαδοποίηση (Metagenomic Binning)Μοριακή ΠροσδέσηMulti-omics epigenome-wide association studyΑνάλυση eQTL πολλαπλών ωμικών δεδομένωνΑνάλυση Εμπλουτισμού Γονιδιακών Συνόλων Πολλαπλών «Ωμικών» ΔεδομένωνΑνάλυση Πολλαπλών Ωμικών Δεδομένων ΜεταβολομικήςΑνάλυση πολλαπλών ωμικών δεδομένων μικροβιακής ποικιλότηταςΑνάλυση Εμπλουτισμού Μονοπατιών Πολλαπλών Ωμικών ΔεδομένωνΠολυομική Φυλογενετική ΑνάλυσηΠρωτεομική ανάλυση πολλαπλών ωμικών δεδομένωνΑνάλυση Διαφορικής Έκφρασης Multi-omics RNA-seqΑνάλυση Multi-omics Μονοκυτταρικού RNA-seqΑνάλυση Παραλλαγών Αριθμού Αντιγράφων Βάσει ΔικτύουΜελέτη Συσχέτισης Επιγονιδιώματος βάσει Δικτύων (Network EWAS)Ανάλυση eQTL βασισμένη σε ΔίκτυαΔιαγενωμικές Μελέτες Συσχέτισης Βάσει ΔικτύουΑνάλυση Μεταβολομικής Βάσει ΔικτύωνΑνάλυση Διαφορετικότητας Μικροβιώματος Βασισμένη σε ΔίκτυαΑνάλυση Εμπλουτισμού Μονοπατιών Βάσει ΔικτύουΑνάλυση Φυλογενετικής Βάσει ΔικτύουΑνάλυση Διαφορικής Έκφρασης RNA-seq Βάσει ΔικτύουΑνάλυση Αλληλουχιών RNA-seq Μοναδιαίων Κυττάρων Βάσει ΔικτύωνNetwork-based Variant CallingΑνάλυση Εμπλουτισμού Βιολογικών ΟδώνΜοντελοποίηση ΦαρμακοφόρουΦυλογενετική ΑνάλυσηΦυλογενετικές Ανεξάρτητες ΑντιθέσειςΠολυγονιδιακή Βαθμολογία ΚινδύνουΤοπολογία Δικτύου Αλληλεπιδράσεων Πρωτεϊνών-ΠρωτεϊνώνΑνάλυση ΠρωτεωμικήςQSARΧαρτογράφηση QTLΤαχύτητα RNA (RNA Velocity)Ανάλυση Διαφορικής Έκφρασης RNA-seqΣάρωση Επιλογής (D του Tajima)Ευθυγράμμιση ΑκολουθιώνΕπισήμανση Κορυφών σε Δεδομένα ChIP-seq Μοναδιαίων ΚυττάρωνΑνάλυση Μεταλλάξεων Αριθμού Αντιγράφων Μοναδιαίου ΚυττάρουΜελέτη συσχέτισης επιγονιδιώματος σε επίπεδο μεμονωμένων κυττάρων (scEWAS)Ανάλυση eQTL Μοναδιαίων ΚυττάρωνSingle-cell Gene Set Enrichment AnalysisSingle-cell GWASΑνάλυση Μεταβολομικής Μοναδιαίων ΚυττάρωνΑνάλυση ποικιλότητας μικροβιώματος μοναδιαίων κυττάρωνΑνάλυση Φυλογενετικής Μοναδιαίων ΚυττάρωνΑνάλυση RNA-seq Μοναδιαίων ΚυττάρωνΑνάλυση διαφορικής έκφρασης σε επίπεδο μοναδιαίου κυττάρου RNA-seqΕυθυγράμμιση Αλληλουχιών Μοναδιαίων ΚυττάρωνΑνίχνευση παραλλαγών σε μεμονωμένα κύτταραΕπισήμανση Κορυφών ChIP-seq ΧρονοσειρώνΑνάλυση Χρόνιων Μεταβολών Αριθμού ΑντιγράφωνΕπιδημιολογική Μελέτη Επιγενωμικής Συσχέτισης ΧρονοσειρώνΑνάλυση χρονοσειρών eQTLΑνάλυση Εμπλουτισμού Γονιδιακών Συνόλων ΧρονοσειρώνΑνάλυση Μεταβολομικής ΧρονοσειρώνΑνάλυση Χρονοσειρών της Μικροβιακής ΠοικιλότηταςΑνάλυση Εμπλουτισμού Μονοπατιών ΧρονοσειρώνΧρονοσειριακή Φυλογενετική ΑνάλυσηΑνάλυση Πρωτεομικής ΧρονοσειρώνΑνάλυση διαφορικής έκφρασης RNA-seq χρονοσειρώνΑνάλυση Αλληλουχιών RNA Μονοκυτταρικής Σειράς ΧρόνουΚλήση Παραλλαγών ΧρονοσειρώνΔοκιμή Ανισορροπίας ΜετάδοσηςVariant Calling

Περισσότερα στην ενότητα Επεξεργασία Σήματος και Επιστημονικοί Υπολογισμοί