Διαφορική Ανάλυση scRNA-seq

Η διαφορική ανάλυση RNA-seq μονής κυψέλης (scRNA-seq) είναι μια υπολογιστική ροή εργασιών που συγκρίνει μεταγραφικά προφίλ μεταξύ βιολογικών συνθηκών — όπως επεξεργασμένες έναντι ανεπεξέργαστων, ασθενείς έναντι υγιών, ή χρονικά σημεία — σε ανάλυση μονής κυψέλης. Προσδιορίζει ποια γονίδια, τύποι κυττάρων και καταστάσεις κυττάρων μεταβάλλονται μεταξύ των συνθηκών, παρέχοντας μηχανιστικές γνώσεις που οι συγκρίσεις RNA-seq χύδην (bulk RNA-seq) δεν μπορούν να προσφέρουν. Η προσέγγιση συνδυάζει ομαδοποίηση (clustering), σχολιασμό τύπου κυττάρου (cell-type annotation) και στατιστικό έλεγχο, χρησιμοποιώντας συνήθως συγκέντρωση ψευδο-χύδην (pseudobulk aggregation) για τη λήψη υπόψη της συσχέτισης εντός του δείγματος.