Αναζήτηση Προφίλ HMMER
Η αναζήτηση προφίλ HMMER εντοπίζει απομακρυσμένους ομόλογους αλληλουχιών πρωτεϊνών χρησιμοποιώντας πιθανολογικά μοντέλα οικογενειών πρωτεϊνών, γνωστά ως κρυφά Μαρκοβιανά Μοντέλα προφίλ (HMMs). Αναπτυγμένη από τον Eddy και συνεργάτες, αυτή η μέθοδος αποτυπώνει μοτίβα διακύμανσης αλληλουχιών εντός οικογενειών πρωτεϊνών και ανιχνεύει ομόλογους με πολύ μεγαλύτερη ευαισθησία από πίνακες βαρύτητας θέσης ή διμερείς ευθυγραμμίσεις.
Διαβάστε ολόκληρη τη μέθοδο
Συνδεθείτε με δωρεάν λογαριασμό για να διαβάσετε αυτή την ενότητα.
Χάρτης μεθόδων
Η γειτονιά των σχετιζόμενων μεθόδων — επιλέξτε έναν κόμβο για εξερεύνηση.
Πηγές
- Krogh, A., Brown, M., Mian, I. S., Sjölander, K., & Haussler, D. (1994). Hidden Markov models in computational biology: applications to protein modeling. Journal of Molecular Biology, 235(5), 1501-1531. DOI: 10.1006/jmbi.1994.1104 ↗
- Eddy, S. R. (1998). Profile hidden Markov models. Bioinformatics, 14(9), 755-763. DOI: 10.1093/bioinformatics/14.9.755 ↗
- Finn, R. D., Clements, J., & Eddy, S. R. (2011). HMMER web server: interactive sequence similarity searching. Nucleic Acids Research, 39(Web Server issue), W29-W37. DOI: 10.1093/nar/gkr367 ↗
Πώς να παραπέμψετε σε αυτή τη σελίδα
ScholarGate. (2026, June 3). Hidden Markov Model Profile Search for Sequence Homology. ScholarGate. https://scholargate.app/el/bioinformatics/hmmer-profile-search
Ποια μέθοδος;
Τοποθετήστε αυτή τη μέθοδο δίπλα στις πιο συγγενείς της και διαβάστε τις παράλληλα — η βιβλιοθήκη απλώνει τα βιβλία στο τραπέζι· η επιλογή είναι δική σας.
- Ανασύσταση με Κρυο-Ηλεκτρονική ΜικροσκοπίαΒιοπληροφορική↔ σύγκριση
- Μεταγονιδιωματική ομαδοποίηση (Metagenomic Binning)Βιοπληροφορική↔ σύγκριση
- Μοριακή ΠροσδέσηΒιοπληροφορική↔ σύγκριση
Αναφέρεται από
Similar methods
Εντοπίσατε πρόβλημα σε αυτή τη σελίδα; Αναφέρετέ το ή προτείνετε διόρθωση →