Ανάλυση διαφορικής έκφρασης σε επίπεδο μοναδιαίου κυττάρου RNA-seq

Η ανάλυση διαφορικής έκφρασης (scRNA-seq DE) σε επίπεδο μοναδιαίου κυττάρου RNA-seq εντοπίζει γονίδια των οποίων τα επίπεδα έκφρασης διαφέρουν σημαντικά μεταξύ καθορισμένων ομάδων μεμονωμένων κυττάρων — όπως τύποι κυττάρων, καταστάσεις ασθένειας ή συνθήκες θεραπείας. Σε αντίθεση με την ανάλυση RNA-seq χύδην (bulk RNA-seq), η οποία υπολογίζει τον μέσο όρο σημάτων από εκατομμύρια κύτταρα, η scRNA-seq DE λειτουργεί στο μεταγραφώμα κάθε μεμονωμένου κυττάρου, επιτρέποντας λεπτομερή χαρακτηρισμό της γονιδιακής ρύθμισης ειδικά για πληθυσμούς κυττάρων και της ετερογένειας εντός φαινομενικά ομοιογενών ιστών.