Ανίχνευση παραλλαγών σε μεμονωμένα κύτταρα — ανίχνευση μεταλλάξεων με κυτταρική ανάλυση
Η ανίχνευση παραλλαγών σε μεμονωμένα κύτταρα είναι μια βιοπληροφορική ροή εργασιών που εντοπίζει παραλλαγές στην αλληλουχία του DNA — παραλλαγές μονού νουκλεοτιδίου (SNVs), μικρές εισαγωγές και διαγραφές, και αλλαγές στον αριθμό των αντιγράφων — εντός μεμονωμένων κυττάρων αντί για ένα σύνολο ιστού. Αναλύοντας το μεταλλαξιογόνο τοπίο κύτταρο προς κύτταρο, αποκαλύπτει την ενδο-ογκολογική ετερογένεια, την κλωνική αρχιτεκτονική και τα μοτίβα σωματικών μεταλλάξεων που η μαζική αλληλούχιση αποκρύπτει. Η προσέγγιση είναι κεντρική στη γονιδιωματική του καρκίνου, τη βιολογία της ανάπτυξης και οποιαδήποτε μελέτη όπου η γενετική ποικιλομορφία μεταξύ των κυττάρων είναι το κύριο ερώτημα.
Διαβάστε ολόκληρη τη μέθοδο
Συνδεθείτε με δωρεάν λογαριασμό για να διαβάσετε αυτή την ενότητα.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Πηγές
- Zafar, H., Wang, Y., Nakhleh, L., Navin, N., & Chen, K. (2016). Monovar: single-nucleotide variant detection in single cells. Nature Methods, 13(6), 505–507. DOI: 10.1038/nmeth.3835 ↗
- Singer, J., Ruscheweyh, H. J., Doherr, M. G., Stadler, T., & Althaus, C. L. (2021). Single-nucleotide variant calling in single-cell sequencing data with piccolo. BMC Bioinformatics, 22(1), 333. link ↗
Πώς να παραπέμψετε σε αυτή τη σελίδα
ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell Genomic Variant Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/el/bioinformatics/single-cell-variant-calling
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Ανάλυση Μεταλλάξεων Αριθμού ΑντιγράφωνΒιοπληροφορική↔ compare
Αναφέρεται από
Εντοπίσατε πρόβλημα σε αυτή τη σελίδα; Αναφέρετέ το ή προτείνετε διόρθωση →