Ανάλυση Φυλογενετικής Μοναδιαίων Κυττάρων — Ανακατασκευή Δέντρων Γενεαλογίας σε Ανάλυση Μοναδιαίων Κυττάρων
Η φυλογενετική ανάλυση μοναδιαίων κυττάρων ανακατασκευάζει εξελικτικά ή αναπτυξιακά δέντρα από δεδομένα αλληλούχισης μοναδιαίων κυττάρων, ανιχνεύοντας πώς μεμονωμένα κύτταρα αποκλίνουν από έναν κοινό πρόγονο. Αξιοποιώντας σωματικές μεταλλάξεις, κωδικοποιητές (barcodes) που εισάγονται με CRISPR ή αλλαγές στον αριθμό των αντιγράφων ως κληρονομήσιμα χαρακτηριστικά, αυτή η μέθοδος χαρτογραφεί τις κλωνικές σχέσεις εντός όγκων, αναπτυσσόμενων ιστών ή ανοσολογικών ρεπερτορίων με πρωτοφανή κυτταρική ανάλυση.
Διαβάστε ολόκληρη τη μέθοδο
Συνδεθείτε με δωρεάν λογαριασμό για να διαβάσετε αυτή την ενότητα.
Χάρτης μεθόδων
Η γειτονιά των σχετιζόμενων μεθόδων — επιλέξτε έναν κόμβο για εξερεύνηση.
Πηγές
- Jones, M. G., Khodaverdian, A., Quinn, J. J., Chan, M. M., Hussmann, J. A., Wang, R., Xu, C., Weissman, J. S., & Yosef, N. (2020). Inference of single-cell phylogenies from lineage tracing data using Cassiopeia. Genome Biology, 21(1), 92. DOI: 10.1186/s13059-020-02000-8 ↗
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
Πώς να παραπέμψετε σε αυτή τη σελίδα
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Phylogenetic and Lineage Tree Reconstruction. ScholarGate. https://scholargate.app/el/bioinformatics/single-cell-phylogenetic-analysis
Ποια μέθοδος;
Τοποθετήστε αυτή τη μέθοδο δίπλα στις πιο συγγενείς της και διαβάστε τις παράλληλα — η βιβλιοθήκη απλώνει τα βιβλία στο τραπέζι· η επιλογή είναι δική σας.
- Ανάλυση Μεταλλάξεων Αριθμού ΑντιγράφωνΒιοπληροφορική↔ σύγκριση
- Φυλογενετική ΑνάλυσηΒιοπληροφορική↔ σύγκριση
- Ανάλυση RNA-seq Μοναδιαίων ΚυττάρωνΒιοπληροφορική↔ σύγκριση
- Variant CallingΒιοπληροφορική↔ σύγκριση
Εντοπίσατε πρόβλημα σε αυτή τη σελίδα; Αναφέρετέ το ή προτείνετε διόρθωση →