Process / pipelineBioinformatics / omics

Επισήμανση Κορυφών σε Δεδομένα ChIP-seq Μοναδιαίων Κυττάρων — Προφίλ Επιγονιδιώματος scChIP-seq

Η επισήμανση κορυφών σε δεδομένα ChIP-seq μοναδιαίων κυττάρων (single-cell ChIP-seq peak calling) είναι μια βιοπληροφορική ροή εργασιών που εντοπίζει γονιδιωματικές περιοχές εμπλουτισμένες για τροποποιήσεις ιστονών ή πρόσδεση παραγόντων μεταγραφής σε μεμονωμένα κύτταρα. Με τη χαρτογράφηση καταστάσεων χρωματίνης σε ανάλυση μοναδιαίου κυττάρου, αποκαλύπτει την επιγονιδιωματική ετερογένεια που κρύβεται σε πειράματα ChIP-seq όγκου, επιτρέποντας στους ερευνητές να χαρτογραφήσουν ρυθμιστικά τοπία σε διακριτούς πληθυσμούς κυττάρων εντός ενός σύνθετου ιστικού δείγματος.

Άνοιγμα στο MethodMindΣύντομαΒίντεοΣύντομαDownload slides

Διαβάστε ολόκληρη τη μέθοδο

Μόνο για μέλη

Συνδεθείτε με δωρεάν λογαριασμό για να διαβάσετε αυτή την ενότητα.

Σύνδεση

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Πηγές

  1. Grosselin, K., Durand, A., Marsolier, J., Poitou, A., Marangoni, E., Nemati, F., ... & Vallot, C. (2019). High-throughput single-cell ChIP-seq identifies heterogeneity of chromatin states in breast cancer. Nature Genetics, 51(6), 1060-1066. link
  2. Ku, W. L., Nakamura, K., Gao, W., Cui, K., Hu, G., Tang, Q., ... & Zhao, K. (2019). Single-cell chromatin immunocleavage sequencing (scChIC-seq) to profile histone modification. Nature Methods, 16(4), 323-325. link

Πώς να παραπέμψετε σε αυτή τη σελίδα

ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/el/bioinformatics/single-cell-chip-seq-peak-calling

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side
ScholarGateSingle-cell ChIP-seq peak calling (Single-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling). Ανακτήθηκε στις 2026-06-15 από https://scholargate.app/el/bioinformatics/single-cell-chip-seq-peak-calling · Σύνολο δεδομένων: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026