Process / pipelineBioinformatics / omics

ChIP-seq Peak Calling — Εντοπισμός Κορυφών Αλληλουχίας Ανοσοκατακρήμνισης Χρωματίνης

Ο εντοπισμός κορυφών ChIP-seq είναι μια υπολογιστική διαδικασία που προσδιορίζει γονιδιωματικές περιοχές όπου μια πρωτεΐνη ενδιαφέροντος — ένας μεταγραφικός παράγοντας ή μια τροποποίηση ιστόνης — είναι εμπλουτισμένη, με βάση τις αναγνώσεις αλληλουχίας από πειράματα ανοσοκατακρήμνισης χρωματίνης. Μετατρέπει τα ακατέργαστα δεδομένα αλληλουχίας σε ένα σύνολο θέσεων δέσμευσης ή τροποποίησης υψηλής αξιοπιστίας σε όλο το γονιδίωμα, επιτρέποντας την περαιτέρω ανάλυση της ρύθμισης των γονιδίων, της κατάστασης της χρωματίνης και των επιγενετικών μηχανισμών.

Άνοιγμα στο MethodMindΣύντομαΒίντεοΣύντομαDownload slides

Διαβάστε ολόκληρη τη μέθοδο

Μόνο για μέλη

Συνδεθείτε με δωρεάν λογαριασμό για να διαβάσετε αυτή την ενότητα.

Σύνδεση

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

+3 more

Πηγές

  1. Zhang, Y., Liu, T., Meyer, C. A., Eeckhoute, J., Johnson, D. S., Bernstein, B. E., Nusbaum, C., Myers, R. M., Brown, M., Li, W., & Liu, X. S. (2008). Model-based analysis of ChIP-seq (MACS). Genome Biology, 9(9), R137. DOI: 10.1186/gb-2008-9-9-r137
  2. Landt, S. G., Marinov, G. K., Kundaje, A., Kheradpour, P., Pauli, F., Batzoglou, S., Bernstein, B. E., Bickel, P., Brown, J. B., Cayting, P., Chen, Y., DeSalvo, G., Epstein, C., Fisher-Aylor, K. I., Euskirchen, G., Gerstein, M., Gertz, J., Hartemink, A. J., Hoffman, M. M., ... Snyder, M. (2012). ChIP-seq guidelines and practices of the ENCODE and modENCODE consortia. Genome Research, 22(9), 1813–1831. DOI: 10.1101/gr.136184.111

Πώς να παραπέμψετε σε αυτή τη σελίδα

ScholarGate. (2026, June 3). Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/el/bioinformatics/chip-seq-peak-calling

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side

Αναφέρεται από

ScholarGateChIP-seq Peak Calling (Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling). Ανακτήθηκε στις 2026-06-15 από https://scholargate.app/el/bioinformatics/chip-seq-peak-calling · Σύνολο δεδομένων: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026