Process / pipelineMetagenomics

Μεταγονιδιωματική ομαδοποίηση (Metagenomic Binning)

Η μεταγονιδιωματική ομαδοποίηση διαμερίζει συναρμολογημένες συνεχείς αλληλουχίες (contigs) από σύνθετες μικροβιακές κοινότητες σε διακριτές ομάδες γονιδιωμάτων (genome bins), καθεμία από τις οποίες αντιπροσωπεύει έναν μεμονωμένο οργανισμό ή στέλεχος. Πρωτοπορώντας από την Banfield και τους συνεργάτες της, αυτή η ροή εργασίας απομονώνει γονιδιώματα μεμονωμένων οργανισμών (μεταγονιδιωματικά συναρμολογημένα γονιδιώματα ή MAGs) από περιβαλλοντικά δείγματα χωρίς να απαιτείται καλλιέργεια απομονωμάτων.

Άνοιγμα στο MethodMindΣύντομαApply, compare, get guidance

Tools & resources

Λήψη διαφανειών

Learn & explore

ΒίντεοΣύντομα

Διαβάστε ολόκληρη τη μέθοδο

Μόνο για μέλη

Συνδεθείτε με δωρεάν λογαριασμό για να διαβάσετε αυτή την ενότητα.

Σύνδεση

Χάρτης μεθόδων

Η γειτονιά των σχετιζόμενων μεθόδων — επιλέξτε έναν κόμβο για εξερεύνηση.

Μεταγονιδιωματική ομαδοποίηση (Metagenomic Binning)

Ανάλυση CRISPR Screen Συναρμολόγηση μεταγραφομ…Αναζήτηση Προφίλ HMMER

Πηγές

Kang, D. D., Froula, J., Egan, R., & Wang, Z. (2015). MetaBAT, an efficient tool for accurately reconstructing single genomes from complex microbial communities. PeerJ, 3, e1165. DOI: 10.7717/peerj.1165 ↗
Jain, C., Rodriguez-R, L. M., Phillippy, A. M., Konstantinidis, K. T., & Aluru, S. (2018). High throughput ANI analysis of 90K prokaryotic genomes reveals clear species boundaries. Nature Communications, 9(1), 4045. DOI: 10.1038/s41467-018-07641-9 ↗
Sieber, C. M. K., Probst, A. J., Sharrar, A., Thomas, B. C., Hess, M., Tringe, S. G., & Banfield, J. F. (2018). Recovery of genomes from metagenomes via a dereplication, aggregation and scoring strategy. Nature Microbiology, 3(7), 836-843. DOI: 10.1038/s41564-018-0171-1 ↗

Πώς να παραπέμψετε σε αυτή τη σελίδα

ScholarGate. (2026, June 3). Metagenome Assembly and Genome Binning. ScholarGate. https://scholargate.app/el/bioinformatics/metagenomic-binning

Ποια μέθοδος;

Τοποθετήστε αυτή τη μέθοδο δίπλα στις πιο συγγενείς της και διαβάστε τις παράλληλα — η βιβλιοθήκη απλώνει τα βιβλία στο τραπέζι· η επιλογή είναι δική σας.