Ανάλυση CRISPR Screen
Η ανάλυση CRISPR screen επεξεργάζεται δεδομένα από συγκεντρωτικές γενετικές διαλογές (pooled genetic screens) χρησιμοποιώντας CRISPR-Cas9 για τον εντοπισμό γονιδίων που απαιτούνται για την ανάπτυξη, την επιβίωση ή τον φαινότυπο των κυττάρων υπό συγκεκριμένες συνθήκες. Αναπτύχθηκε από τους Zhang, Sanjana και άλλους, αυτή η υπολογιστική διαδικασία μετατρέπει τις αναγνώσεις αλληλούχισης των αφθονιών των οδηγών RNA σε ταξινομημένες λίστες λειτουργικών γονιδίων.
Διαβάστε ολόκληρη τη μέθοδο
Συνδεθείτε με δωρεάν λογαριασμό για να διαβάσετε αυτή την ενότητα.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Πηγές
- Shalem, O., Sanjana, N. E., Hartenian, E., Shi, X., Scott, D. A., Mikkelsen, T. S., ... & Zhang, F. (2014). Genome-scale CRISPR-Cas9 knockout screening in human cells. Science, 343(6166), 84-87. DOI: 10.1126/science.1247005 ↗
- Hart, T., Chandrashekhar, M., Aregger, M., Steinhart, Z., Brown, K. R., MacLeod, G., ... & Moffat, J. (2015). High-resolution CRISPR screens reveal fitness genes and pathways. Molecular Systems Biology, 11(8), 820. link ↗
- King, J. B., Palmer, A. C., & Sorger, P. K. (2020). Application of a genetic algorithm designed for flexible objective optimization in pharmaceutical research and development. Cancer Research, 79(13 Supplement), 3435. link ↗
Πώς να παραπέμψετε σε αυτή τη σελίδα
ScholarGate. (2026, June 3). CRISPR Screening Data Analysis and Hit Identification. ScholarGate. https://scholargate.app/el/bioinformatics/crispr-screen-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Συναρμολόγηση μεταγραφομικών δεδομένων de novoΒιοπληροφορική↔ compare
- Αναζήτηση Προφίλ HMMERΒιοπληροφορική↔ compare
- Μεταγονιδιωματική ομαδοποίηση (Metagenomic Binning)Βιοπληροφορική↔ compare
Αναφέρεται από
Εντοπίσατε πρόβλημα σε αυτή τη σελίδα; Αναφέρετέ το ή προτείνετε διόρθωση →