Ευθυγράμμιση Αλληλουχιών Μοναδιαίων Κυττάρων — Αντιστοίχιση Αναγνώσεων scRNA-seq

Η ευθυγράμμιση αλληλουχιών μοναδιαίων κυττάρων είναι το υπολογιστικό βήμα που αντιστοιχίζει εκατομμύρια σύντομες αναγνώσεις αλληλούχισης που παράγονται από πειράματα μοναδιαίων κυττάρων RNA-seq σε ένα γονιδίωμα ή μεταγράφωμα αναφοράς. Σε αντίθεση με την ευθυγράμμιση RNA-seq όγκου, κάθε ανάγνωση φέρει έναν κυτταρικό κωδικό (barcode) και έναν Μοναδικό Αναγνωριστικό Μορίου (UMI) που μαζί προσδιορίζουν το κυτταρικό αρχικό και το μεμονωμένο μόριο RNA. Η ακριβής ευθυγράμμιση και η αποκωδικοποίηση των κωδικών είναι προαπαιτούμενα για την κατασκευή του πίνακα μετρήσεων κυττάρου ανά γονίδιο που καθοδηγεί όλες τις επακόλουθες αναλύσεις μοναδιαίων κυττάρων.