Process / pipelineEpigenomics

Ανάλυση ATAC-seq

Το ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) είναι μια μέθοδος για τη χαρτογράφηση του τοπίου της προσβασιμότητας της χρωματίνης σε ολόκληρο το γονιδίωμα. Αναπτύχθηκε από τους Buenrostro και συνεργάτες το 2013, το ATAC-seq χρησιμοποιεί μια υπερδραστήρια τρανσποζάση για την επισήμανση ανοιχτών, προσβάσιμων περιοχών χρωματίνης, επιτρέποντας την ταχεία και ευαίσθητη αναγνώριση ρυθμιστικών στοιχείων DNA. Το ATAC-seq έχει γίνει μια τυπική τεχνική για τον χαρακτηρισμό ρυθμιστικών τοπίων γονιδίων, την ανακάλυψη ρυθμιστικών στοιχείων ειδικών για τον κυτταρικό τύπο και την εξαγωγή συμπερασμάτων για ρυθμιστικά δίκτυα γονιδίων.

Άνοιγμα στο MethodMindΣύντομαΒίντεοΣύντομαDownload slides

Διαβάστε ολόκληρη τη μέθοδο

Μόνο για μέλη

Συνδεθείτε με δωρεάν λογαριασμό για να διαβάσετε αυτή την ενότητα.

Σύνδεση

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Ανάλυση ATAC-seq

Ανάλυση Hi-C Ταχύτητα RNA (RNA Veloci…ChIP-seq Peak Calling Διαφορική Ανίχνευση Κορυ…Επισήμανση Κορυφών ChIP-…

Πηγές

Buenrostro, J. D., Giresi, P. G., Zaba, L. C., Chang, H. Y., & Greenleaf, W. J. (2013). Transposition of native chromatin for fast and sensitive epigenomic profiling of cell populations and tissues. Nature Methods, 10(12), 1213–1218. link ↗
Corces, M. R., Buenrostro, J. D., Wu, B., Greenside, P. G., Chan, S. M., Koenig, J. L., & Greenleaf, W. J. (2017). Lineage-specific and single-cell chromatin accessibility charts human hematopoiesis. Nature Genetics, 48(10), 1193–1203. DOI: 10.1038/ng.3646 ↗
Satpathy, A. T., Granja, J. M., Yost, K. E., Qi, Y., Meschi, F., McDermott, G. P., & Chang, H. Y. (2019). Massively parallel single-cell chromatin landscapes. Nature Biotechnology, 37(12), 1452–1462. link ↗

Πώς να παραπέμψετε σε αυτή τη σελίδα

ScholarGate. (2026, June 3). ATAC-seq Analysis for Chromatin Accessibility and Regulatory Landscapes. ScholarGate. https://scholargate.app/el/genetics/atac-seq-analysis