Ανάλυση διαφορικής έκφρασης RNA-seq χρονοσειρών — Χρονική μεταγραφομική

Η ανάλυση διαφορικής έκφρασης RNA-seq χρονοσειρών εντοπίζει γονίδια των οποίων τα επίπεδα έκφρασης μεταβάλλονται συστηματικά σε διατεταγμένες χρονικές στιγμές — όπως κατά την ανάπτυξη, την εξέλιξη μιας νόσου ή την απόκριση σε μια θεραπεία. Σε αντίθεση με την ανάλυση διαφορικής έκφρασης δύο συνθηκών, μοντελοποιεί ρητά τη χρονική δομή των δεδομένων, συλλαμβάνοντας δυναμικές τροχιές έκφρασης γονιδίων αντί για μια απλή αντίθεση στιγμιότυπου. Εργαλεία όπως τα maSigPro, ImpulseDE2 και splineTimeR έχουν αναπτυχθεί ειδικά για αυτόν τον σχεδιασμό.