Сетевой GWAS — полногеномное исследование ассоциаций на основе сетей
Сетевой GWAS интегрирует результаты стандартных полногеномных исследований ассоциаций с данными биологических сетей — такими как сети белок-белковых взаимодействий (PPI) или графы генной коэкспрессии — для выявления релевантных для заболевания генных модулей или подсетей. Вместо того чтобы сообщать только о наиболее значимых отдельных однонуклеотидных полиморфизмах (SNP), этот подход распространяет сигналы ассоциации через сети молекулярных взаимодействий, выявляя кластеры генов, чей коллективный сигнал указывает на их участие в биологии сложных признаков, даже если ни один отдельный вариант сам по себе не достигает полногеномной значимости.
Читать метод полностью
Войдите с бесплатным аккаунтом, чтобы прочитать этот раздел.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Источники
- Wang, Q., Yu, H., Zhao, Z., & Jia, P. (2015). EW_dmGWAS: edge-weighted dense module search for genome-wide association studies and gene expression profiles. Bioinformatics, 31(15), 2591–2594. link ↗
- Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations contributing to tumorigenesis. Nature Genetics, 47(2), 106–114. link ↗
Как цитировать эту страницу
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Genome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/ru/bioinformatics/network-based-gwas
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Анализ вариаций числа копийБиоинформатика↔ compare
- eQTL АнализБиоинформатика↔ compare
- Анализ обогащения генных наборов (GSEA)Биоинформатика↔ compare
- Полногеномный поиск ассоциаций (GWAS)Биоинформатика↔ compare
- Сетевой анализ eQTLБиоинформатика↔ compare
- Анализ обогащения сигнальных путейБиоинформатика↔ compare
Упоминается в
Нашли ошибку на этой странице? Сообщите о ней или предложите исправление →