Сетевой анализ вариаций числа копий
Сетевой анализ вариаций числа копий (ВЧК) интегрирует геномные данные ВЧК с биологическими сетями взаимодействий — такими как сети белок-белковых взаимодействий (ББВ) или сетевые пути — для идентификации функционально когерентных областей, драйверных генов и измененных подсетей, которые не могут быть обнаружены при использовании только сырых данных ВЧК. Распространяя сигналы ВЧК по графу сети, метод выявляет скоординированные дисбалансы доз генома, которые сходятся на общих биологических функциях, что делает его особенно мощным в онкогеномике и исследованиях редких заболеваний.
Читать метод полностью
Войдите с бесплатным аккаунтом, чтобы прочитать этот раздел.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Источники
- Vandin, F., Upfal, E., & Raphael, B. J. (2012). De novo discovery of mutated driver pathways in cancer. Genome Research, 22(2), 375–385. DOI: 10.1101/gr.120477.111 ↗
- Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations across pathways and protein complexes. Nature Genetics, 47(2), 106–114. DOI: 10.1038/ng.3168 ↗
Как цитировать эту страницу
ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ru/bioinformatics/network-based-copy-number-variation-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Анализ вариаций числа копийБиоинформатика↔ compare
- Анализ обогащения генных наборов (GSEA)Биоинформатика↔ compare
- Сетевой GWASБиоинформатика↔ compare
- Сетевой анализ дифференциальной экспрессии РНК-секБиоинформатика↔ compare
- Анализ обогащения сигнальных путейБиоинформатика↔ compare
- Вызов вариантовБиоинформатика↔ compare
Нашли ошибку на этой странице? Сообщите о ней или предложите исправление →