Байесовский поиск пиков ChIP-seq — вероятностное определение обогащения в эпигеномных данных

Байесовский поиск пиков ChIP-seq применяет вероятностные модели — обычно модели Пуассона, отрицательного биномиального распределения или скрытые марковские модели с байесовским выводом — для обнаружения геномных областей, обогащенных интересующим белком, в экспериментах по иммунопреципитации хроматина с последующим секвенированием. Явно моделируя шум подсчета прочтений и включая априорные распределения, байесовские алгоритмы выдают апостериорные вероятности обогащения вместо простых p-значений, предоставляя принципиальную основу для количественной оценки неопределенности по всему геному.