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単一細胞微生物多様性解析
単一細胞微生物多様性解析は、個々の細胞または細菌のレベルで微生物群集の組成と機能的多様性を解像する。単一細胞または単一細菌の分離とハイスループットシーケンシングを組み合わせることで、このパイプラインはバルクメタゲノミクスの平均化効果を克服し、腸内、口腔内、または環境サンプルなどの複雑な微生物叢における希少株、種内変異、および細胞間ヘテロジニティの検出を可能にする。
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出典
- Kehe, J., Kulesa, A., Ortiz, A., Ackerman, C. M., Thakku, S. G., Sellers, D., Bhatt, S., ... & Blainey, P. C. (2019). Massively parallel screening of synthetic microbial communities. Proceedings of the National Academy of Sciences, 116(26), 12804-12809. link ↗
- Zheng, W., Zhao, S., Yin, Y., Zhang, H., Needham, D. M., Evans, E. D., Bhatt, S., ... & Bhatt, D. L. (2020). High-throughput, single-microbe genomics with strain resolution, applied to a human gut microbiome. Science, 376(6597), eabm1483. link ↗
このページの引用方法
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Resolution Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ja/bioinformatics/single-cell-microbiome-diversity-analysis
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