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差次的単一細胞RNAシーケンス解析
差次的単一細胞RNAシーケンス(scRNA-seq)解析は、単一細胞解像度で、生物学的条件(処理済み対未処理、疾患対健常、または時点など)間で転写プロファイルを比較する計算パイプラインです。これにより、どの遺伝子、細胞種、細胞状態が条件間で変化するかを特定し、バルクRNAシーケンス比較では提供できないメカニズム的な洞察が得られます。このアプローチは、クラスタリング、細胞種アノテーション、統計的検定を組み合わせ、通常は擬似バルク集計を使用してサンプル内の相関を考慮します。
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出典
- Hafemeister, C., & Satija, R. (2019). Normalization and variance stabilization of single-cell RNA-seq data using regularized negative binomial regression. Genome Biology, 20, 296. link ↗
- Squair, J. W., Gautier, M., Kathe, C., Anderson, M. A., James, N. D., Hutson, T. H., Lefoulon, E., Tani, N., Bhatt, D. L., Rossetti, A., & Courtine, G. (2021). Confronting false discoveries in single-cell differential expression. Nature Communications, 12, 5692. link ↗
このページの引用方法
ScholarGate. (2026, June 3). Differential Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ja/bioinformatics/differential-single-cell-rna-seq-analysis
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