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差次的単一細胞RNAシーケンス解析

差次的単一細胞RNAシーケンス(scRNA-seq)解析は、単一細胞解像度で、生物学的条件(処理済み対未処理、疾患対健常、または時点など)間で転写プロファイルを比較する計算パイプラインです。これにより、どの遺伝子、細胞種、細胞状態が条件間で変化するかを特定し、バルクRNAシーケンス比較では提供できないメカニズム的な洞察が得られます。このアプローチは、クラスタリング、細胞種アノテーション、統計的検定を組み合わせ、通常は擬似バルク集計を使用してサンプル内の相関を考慮します。

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出典

  1. Hafemeister, C., & Satija, R. (2019). Normalization and variance stabilization of single-cell RNA-seq data using regularized negative binomial regression. Genome Biology, 20, 296. link
  2. Squair, J. W., Gautier, M., Kathe, C., Anderson, M. A., James, N. D., Hutson, T. H., Lefoulon, E., Tani, N., Bhatt, D. L., Rossetti, A., & Courtine, G. (2021). Confronting false discoveries in single-cell differential expression. Nature Communications, 12, 5692. link

このページの引用方法

ScholarGate. (2026, June 3). Differential Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ja/bioinformatics/differential-single-cell-rna-seq-analysis

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ScholarGateDifferential single-cell RNA-seq analysis (Differential Single-Cell RNA Sequencing Analysis). 2026-06-15に以下より取得 https://scholargate.app/ja/bioinformatics/differential-single-cell-rna-seq-analysis · データセット: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026