Process / pipelineBioinformatics / omics
シングルセルChIP-seqピークコール — scChIP-seqエピゲノムプロファイリング
シングルセルChIP-seqピークコールは、個々の細胞におけるヒストン修飾や転写因子結合に富むゲノム領域を同定するバイオインフォマティクスパイプラインです。シングルセル解像度でクロマチン状態をプロファイリングすることで、バルクChIP-seq実験では隠されていたエピゲノムの不均一性を明らかにし、複雑な組織サンプル内の異なる細胞集団における制御ランドスケープを研究者がマッピングすることを可能にします。
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出典
- Grosselin, K., Durand, A., Marsolier, J., Poitou, A., Marangoni, E., Nemati, F., ... & Vallot, C. (2019). High-throughput single-cell ChIP-seq identifies heterogeneity of chromatin states in breast cancer. Nature Genetics, 51(6), 1060-1066. link ↗
- Ku, W. L., Nakamura, K., Gao, W., Cui, K., Hu, G., Tang, Q., ... & Zhao, K. (2019). Single-cell chromatin immunocleavage sequencing (scChIC-seq) to profile histone modification. Nature Methods, 16(4), 323-325. link ↗
このページの引用方法
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/ja/bioinformatics/single-cell-chip-seq-peak-calling
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- ChIP-seqピークコーリングバイオインフォマティクス↔ compare
- エピゲノムワイド関連解析（EWAS）バイオインフォマティクス↔ compare
- シングルセルエピゲノムワイド関連解析 (scEWAS)バイオインフォマティクス↔ compare
- Single-cell RNA-seq Analysisバイオインフォマティクス↔ compare
- Single-cell Sequence Alignmentバイオインフォマティクス↔ compare