Chiamata dei picchi ChIP-seq a singola cellula — Profilazione epigenomica scChIP-seq
La chiamata dei picchi ChIP-seq a singola cellula è una pipeline bioinformatica che identifica regioni genomiche arricchite per modificazioni istoniche o legame di fattori di trascrizione in singole cellule. Profilando gli stati della cromatina a risoluzione di singola cellula, rivela l'eterogeneità epigenomica nascosta negli esperimenti ChIP-seq di massa, consentendo ai ricercatori di mappare i paesaggi regolatori attraverso distinte popolazioni cellulari all'interno di un campione tissutale complesso.
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Fonti
- Grosselin, K., Durand, A., Marsolier, J., Poitou, A., Marangoni, E., Nemati, F., ... & Vallot, C. (2019). High-throughput single-cell ChIP-seq identifies heterogeneity of chromatin states in breast cancer. Nature Genetics, 51(6), 1060-1066. link ↗
- Ku, W. L., Nakamura, K., Gao, W., Cui, K., Hu, G., Tang, Q., ... & Zhao, K. (2019). Single-cell chromatin immunocleavage sequencing (scChIC-seq) to profile histone modification. Nature Methods, 16(4), 323-325. link ↗
Come citare questa pagina
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/it/bioinformatics/single-cell-chip-seq-peak-calling
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- ChIP-seq Peak CallingBioinformatica↔ compare
- Studio di Associazione a Livello di Epigenoma (EWAS)Bioinformatica↔ compare
- Studio di associazione sull'epigenoma su singola cellula (scEWAS)Bioinformatica↔ compare
- Analisi RNA-seq a singola cellulaBioinformatica↔ compare
- Allineamento di sequenze a singola cellulaBioinformatica↔ compare
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