Analisi delle variazioni del numero di copie a livello di singola cellula
L'analisi delle variazioni del numero di copie a livello di singola cellula (scCNV) rileva guadagni e perdite di segmenti genomici all'interno di singole cellule, consentendo ai ricercatori di risolvere l'eterogeneità intratumorale, ricostruire l'evoluzione clonale e distinguere le cellule maligne da quelle normali con risoluzione a singola cellula. Può essere applicata direttamente ai dati di sequenziamento dell'intero genoma a singola cellula o dedotta dai segnali di profondità di lettura negli esperimenti scRNA-seq o scATAC-seq.
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Fonti
- Garvin, T., Aboukhalil, R., Kendall, J., Baslan, T., Atwal, G. S., Hicks, J., Wigler, M., & Schatz, M. C. (2015). Interactive analysis and assessment of single-cell copy-number variations. Nature Methods, 12(11), 1058–1060. link ↗
- Gao, R., Bai, S., Henderson, Y. C., Lin, Y., Schalck, A., Yan, Y., Kumar, T., Hu, M., Sei, E., Davis, A., Wang, F., Shaitelman, S. F., Wang, J. R., Chen, K., Moulder, S., Lai, S. Y., & Navin, N. E. (2021). Delineating copy number and clonal substructure in human tumors from single-cell transcriptomes. Nature Biotechnology, 39(5), 599–608. link ↗
Come citare questa pagina
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/it/bioinformatics/single-cell-copy-number-variation-analysis
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