Analisi Filogenetica a Singola Cellula — Ricostruzione di Alberi di Lignaggio a Risoluzione Singola Cellula
L'analisi filogenetica a singola cellula ricostruisce alberi evolutivi o di sviluppo da dati di sequenziamento a singola cellula, tracciando come singole cellule sono diverge da un antenato comune. Sfruttando mutazioni somatiche, barcode introdotti da CRISPR o cambiamenti nel numero di copie come caratteri ereditabili, questo metodo mappa le relazioni clonali all'interno di tumori, tessuti in via di sviluppo o repertori immunitari con una risoluzione cellulare senza precedenti.
Leggi il metodo completo
Accedi con un account gratuito per leggere questa sezione.
Mappa dei metodi
Il vicinato dei metodi correlati — seleziona un nodo per esplorare.
Fonti
- Jones, M. G., Khodaverdian, A., Quinn, J. J., Chan, M. M., Hussmann, J. A., Wang, R., Xu, C., Weissman, J. S., & Yosef, N. (2020). Inference of single-cell phylogenies from lineage tracing data using Cassiopeia. Genome Biology, 21(1), 92. DOI: 10.1186/s13059-020-02000-8 ↗
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
Come citare questa pagina
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Phylogenetic and Lineage Tree Reconstruction. ScholarGate. https://scholargate.app/it/bioinformatics/single-cell-phylogenetic-analysis
Quale metodo?
Affianca questo metodo ai suoi parenti più prossimi e leggili fianco a fianco — la biblioteca dispone i libri sul tavolo; la scelta è tua.
- Analisi delle Variazioni del Numero di CopieBioinformatica↔ confronta
- Analisi FilogeneticaBioinformatica↔ confronta
- Analisi RNA-seq a singola cellulaBioinformatica↔ confronta
- Variant CallingBioinformatica↔ confronta
Hai notato un problema in questa pagina? Segnalalo o proponi una correzione →