RNA-seq анализ на диференциална експресия — Транскриптомен DE анализ
Анализът на диференциална експресия (DE) на RNA-seq идентифицира гени, чиято транскриптна изобилност се различава значително между две или повече биологични състояния — например, третирани спрямо контролни, или болни спрямо здрави тъкани. Започвайки от сурови секвениращи четения, процесът преминава през подравняване, нормализация на базата на броя, статистическо моделиране на дисперсията на броя, тестване на хипотези и корекция за множествено тестване, за да се получи класиран списък на диференциално експресирани гени, придружен от оценки на коефициента на промяна (fold-change) и коригирани p-стойности.
Прочетете целия метод
Влезте с безплатен профил, за да прочетете този раздел.
Карта на методите
Обкръжението на сродните методи — изберете възел, за да го разгледате.
+50 още
Източници
- Love, M. I., Huber, W., & Anders, S. (2014). Moderated estimation of fold change and dispersion for RNA-seq data with DESeq2. Genome Biology, 15(12), 550. DOI: 10.1186/s13059-014-0550-8 ↗
- Robinson, M. D., McCarthy, D. J., & Smyth, G. K. (2010). edgeR: a Bioconductor package for differential expression analysis of digital gene expression data. Bioinformatics, 26(1), 139–140. DOI: 10.1093/bioinformatics/btp616 ↗
Как да цитирате тази страница
ScholarGate. (2026, June 3). RNA Sequencing Differential Expression Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/bg/bioinformatics/rna-seq-differential-expression
Кой метод?
Поставете този метод до най-близките му сродни методи и ги четете едно до друго — библиотеката полага книгите на масата; изборът е ваш.
- Извикване на пикове в ChIP-seqБиоинформатика↔ сравняване
- Анализ на обогатяване на генни набори (GSEA)Биоинформатика↔ сравняване
- Анализ на обогатяване на пътищаБиоинформатика↔ сравняване
- Подравняване на последователностиБиоинформатика↔ сравняване
- Анализ на едноклетъчна РНК секвенция (scRNA-seq)Биоинформатика↔ сравняване
- Вариантно призоваванеБиоинформатика↔ сравняване
Цитиран в
Забелязахте ли проблем на тази страница? Съобщете или предложете поправка →